RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.08■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.08■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.07■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF15Q9NS87 1388 aa15.07■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP7AQ04656 1500 aa15.07■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.06■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.05■□□□□ -0
GTPBP1-211ENST00000487538 NEUROD1Q13562 356 aa15.04■□□□□ -0
GTPBP1-211ENST00000487538 PZPP20742 1482 aa15.02■□□□□ -0
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.01□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 TONSLQ96HA7 1378 aa15□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 C3P01024 1663 aa15□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 PREX1Q8TCU6 1659 aa15□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.99□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 MROH2AA6NES4 1674 aa14.98□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.98□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 MLECQ14165 292 aa14.97□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.97□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 UNC13BO14795 1591 aa14.96□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 ERBINQ96RT1 1412 aa14.96□□□□□ -0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP155O75694 1391 aa14.96□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 A2MP01023 1474 aa14.95□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXD1Q16676 465 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 PKD2Q13563 968 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 STRCQ7RTU9 1775 aa14.85□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.84□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPA2P54652 639 aa14.84□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NPATQ14207 1427 aa14.83□□□□□ -0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DEPDC5O75140 1603 aa14.83□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.83□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.82□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMYM3Q14202 1370 aa14.79□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.77□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 KANK1Q14678 1352 aa14.77□□□□□ -0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.75□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TET3O43151 1660 aa14.75□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCC3O15438 1527 aa14.75□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2R1Q13018 1463 aa14.75□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.74□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF3BO15066 747 aa14.74□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GGT6Q6P531 493 aa14.74□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP152O94986 1710 aa14.73□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 E9PCH4 1651 aa14.72□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.72□□□□□ -0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPM2O94759 1503 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRTO14522 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVK-7P63135 1459 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TNRQ92752 1358 aa14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP1Q9C000 1473 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 CLTCL1P53675 1640 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MIER1Q8N108 512 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO41Q8TF61 875 aa14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.59□□□□□ -0.07
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