RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.31■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.31■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.29■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.26■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.26■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.25■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.25■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 C3P01024 1663 aa25.24■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 UNC13BO14795 1591 aa25.23■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 KIF3BO15066 747 aa25.22■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 MLECQ14165 292 aa25.22■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 ABCC3O15438 1527 aa25.22■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 HFM1A2PYH4 1435 aa25.21■■□□□ 1.63
HCLS1-208ENST00000487290 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.19■■□□□ 1.62
HCLS1-208ENST00000487290 NAIPQ13075 1403 aa25.19■■□□□ 1.62
HCLS1-208ENST00000487290 CEP152O94986 1710 aa25.17■■□□□ 1.62
HCLS1-208ENST00000487290 GGT6Q6P531 493 aa25.15■■□□□ 1.62
HCLS1-208ENST00000487290 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.14■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 NPATQ14207 1427 aa25.12■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 ITGAEP38570 1179 aa25.12■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 PZPP20742 1482 aa25.12■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.12■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 ZMYM3Q14202 1370 aa25.11■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.11■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.08■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HCLS1-208ENST00000487290 TET3O43151 1660 aa25.07■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.07■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.06■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 KANK1Q14678 1352 aa25.05■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.05■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HCLS1-208ENST00000487290 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HCLS1-208ENST00000487290 LMTK3Q96Q04 1460 aa25■■□□□ 1.59
HCLS1-208ENST00000487290 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25■■□□□ 1.59
HCLS1-208ENST00000487290 ERVK-7P63135 1459 aa24.98■■□□□ 1.59
HCLS1-208ENST00000487290 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HCLS1-208ENST00000487290 E9PCH4 1651 aa24.95■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.95■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.93■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 NOS1P29475 1434 aa24.92■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 NUP155O75694 1391 aa24.92■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 NLRP1Q9C000 1473 aa24.9■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 TNRQ92752 1358 aa24.9■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 SYNMO15061 1565 aa24.89■■□□□ 1.58
HCLS1-208ENST00000487290 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 PIK3C2BO00750 1634 aa24.86■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.85■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 HRCP23327 699 aa24.85■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.83■■□□□ 1.57
HCLS1-208ENST00000487290 PTPRTO14522 1441 aa24.82■■□□□ 1.56
HCLS1-208ENST00000487290 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.81■■□□□ 1.56
HCLS1-208ENST00000487290 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.8■■□□□ 1.56
HCLS1-208ENST00000487290 PLA2R1Q13018 1463 aa24.79■■□□□ 1.56
HCLS1-208ENST00000487290 TRPM2O94759 1503 aa24.77■■□□□ 1.56
HCLS1-208ENST00000487290 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.76■■□□□ 1.55
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HCLS1-208ENST00000487290 ADGRB3O60242 1522 aa24.74■■□□□ 1.55
HCLS1-208ENST00000487290 STRCQ7RTU9 1775 aa24.74■■□□□ 1.55
HCLS1-208ENST00000487290 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.71■■□□□ 1.55
HCLS1-208ENST00000487290 SLIT1O75093 1534 aa24.7■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM52Q96A61 297 aa24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 CLTCL1P53675 1640 aa24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.66■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 HSPA2P54652 639 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 PKD2Q13563 968 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 IDI1Q13907 227 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-208ENST00000487290 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.63■■□□□ 1.53
HCLS1-208ENST00000487290 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-208ENST00000487290 MED14O60244 1454 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-208ENST00000487290 KIF1BO60333 1816 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-208ENST00000487290 ZFYVE9O95405 1425 aa24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-208ENST00000487290 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HCLS1-208ENST00000487290 IQGAP1P46940 1657 aa24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.51■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 FOXD1Q16676 465 aa24.49■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.47■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 IFT172Q9UG01 1749 aa24.46■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
HCLS1-208ENST00000487290 PPLO60437 1756 aa24.45■■□□□ 1.5
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