RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRN-216ENST00000486480 GGT6Q6P531 493 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRN-216ENST00000486480 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.25■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 ITGAEP38570 1179 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 ROCK1Q13464 1354 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 DEPDC5O75140 1603 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRN-216ENST00000486480 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 CEP152O94986 1710 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRN-216ENST00000486480 ABCC3O15438 1527 aa29.14■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZMYM3Q14202 1370 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRN-216ENST00000486480 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 NPATQ14207 1427 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 UNC13BO14795 1591 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 PZPP20742 1482 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 KANK1Q14678 1352 aa29.01■■■□□ 2.24
PTPRN-216ENST00000486480 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 NAIPQ13075 1403 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 HFM1A2PYH4 1435 aa28.95■■■□□ 2.23
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 TET3O43151 1660 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 ERVK-7P63135 1459 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PTPRN-216ENST00000486480 TNRQ92752 1358 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRN-216ENST00000486480 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PTPRN-216ENST00000486480 HSPA2P54652 639 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRN-216ENST00000486480 NUP155O75694 1391 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRN-216ENST00000486480 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRN-216ENST00000486480 E9PCH4 1651 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRN-216ENST00000486480 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PTPRN-216ENST00000486480 NLRP1Q9C000 1473 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRN-216ENST00000486480 SYNMO15061 1565 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRN-216ENST00000486480 STRCQ7RTU9 1775 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRN-216ENST00000486480 NOS1P29475 1434 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRN-216ENST00000486480 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRN-216ENST00000486480 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.7■■■□□ 2.19
PTPRN-216ENST00000486480 PIK3C2BO00750 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 PLA2R1Q13018 1463 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM52Q96A61 297 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRN-216ENST00000486480 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PTPRN-216ENST00000486480 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRN-216ENST00000486480 ADGRB3O60242 1522 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRN-216ENST00000486480 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 IDI1Q13907 227 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 PTPRTO14522 1441 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 TRPM2O94759 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.52■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 PKD2Q13563 968 aa28.52■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLIT1O75093 1534 aa28.52■■■□□ 2.16
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRN-216ENST00000486480 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRN-216ENST00000486480 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRN-216ENST00000486480 CLTCL1P53675 1640 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRN-216ENST00000486480 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 IQGAP1P46940 1657 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 MED14O60244 1454 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 KIF1BO60333 1816 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 HRCP23327 699 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 FOXD1Q16676 465 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-216ENST00000486480 ZFYVE9O95405 1425 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 LTKP29376 864 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 EID1Q9Y6B2 187 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-216ENST00000486480 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.34■■■□□ 2.13
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