RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485537.1

TTL-204, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 1,094 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-204ENST00000485537 TNRQ92752 1358 aa36.53■■■■□ 3.44
TTL-204ENST00000485537 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.53■■■■□ 3.44
TTL-204ENST00000485537 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
TTL-204ENST00000485537 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.5■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.49■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 MBD5Q9P267 1494 aa36.49■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.48■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.48■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 PZPP20742 1482 aa36.46■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 KIF3BO15066 747 aa36.45■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TTL-204ENST00000485537 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.43■■■■□ 3.42
TTL-204ENST00000485537 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.4■■■■□ 3.42
TTL-204ENST00000485537 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
TTL-204ENST00000485537 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.38■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.38■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.37■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 CEP162Q5TB80 1403 aa36.35■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.35■■■■□ 3.41
TTL-204ENST00000485537 NLRP1Q9C000 1473 aa36.34■■■■□ 3.41
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TTL-204ENST00000485537 IQGAP1P46940 1657 aa36.29■■■■□ 3.4
TTL-204ENST00000485537 MED14O60244 1454 aa36.27■■■■□ 3.4
TTL-204ENST00000485537 ALKQ9UM73 1620 aa36.24■■■■□ 3.39
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TTL-204ENST00000485537 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.21■■■■□ 3.39
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TTL-204ENST00000485537 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
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TTL-204ENST00000485537 TSPY10P0CW01 314 aa36.15■■■■□ 3.38
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TTL-204ENST00000485537 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
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TTL-204ENST00000485537 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
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TTL-204ENST00000485537 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.87■■■■□ 3.33
TTL-204ENST00000485537 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
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TTL-204ENST00000485537 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.84■■■■□ 3.33
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TTL-204ENST00000485537 LTKP29376 864 aa35.83■■■■□ 3.33
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TTL-204ENST00000485537 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.7■■■■□ 3.31
TTL-204ENST00000485537 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.69■■■■□ 3.3
TTL-204ENST00000485537 ERBINQ96RT1 1412 aa35.68■■■■□ 3.3
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TTL-204ENST00000485537 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
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TTL-204ENST00000485537 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
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TTL-204ENST00000485537 KCNA6P17658 529 aa35.58■■■■□ 3.29
TTL-204ENST00000485537 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
TTL-204ENST00000485537 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
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TTL-204ENST00000485537 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.52■■■■□ 3.28
TTL-204ENST00000485537 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TTL-204ENST00000485537 IDI1Q13907 227 aa35.51■■■■□ 3.28
TTL-204ENST00000485537 TET3O43151 1660 aa35.51■■■■□ 3.28
TTL-204ENST00000485537 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
TTL-204ENST00000485537 BCANQ96GW7 911 aa35.5■■■■□ 3.27
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TTL-204ENST00000485537 MSH6P52701 1360 aa35.5■■■■□ 3.27
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TTL-204ENST00000485537 JCADQ9P266 1359 aa35.4■■■■□ 3.26
TTL-204ENST00000485537 NOS1P29475 1434 aa35.39■■■■□ 3.26
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