RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.55■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.54■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 KIF15Q9NS87 1388 aa25.52■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 NPATQ14207 1427 aa25.51■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.51■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.49■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 PTPRKQ15262 1439 aa25.48■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.47■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
VAMP4-204ENST00000482519 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.42■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 ERBINQ96RT1 1412 aa25.42■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 NCOA1Q15788 1441 aa25.4■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.39■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 ITGAEP38570 1179 aa25.39■■□□□ 1.66
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC3O15438 1527 aa25.38■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 PZPP20742 1482 aa25.38■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.37■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 STRCQ7RTU9 1775 aa25.37■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 TNRQ92752 1358 aa25.36■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 CEP152O94986 1710 aa25.36■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 ADGRL2O95490 1459 aa25.34■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.34■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.34■■□□□ 1.65
VAMP4-204ENST00000482519 KANK1Q14678 1352 aa25.31■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 DEPDC5O75140 1603 aa25.28■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.28■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.28■■□□□ 1.64
VAMP4-204ENST00000482519 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 ERVK-7P63135 1459 aa25.22■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 ROCK1Q13464 1354 aa25.22■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 NLRP1Q9C000 1473 aa25.21■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.21■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 PTPRTO14522 1441 aa25.2■■□□□ 1.63
VAMP4-204ENST00000482519 PLA2R1Q13018 1463 aa25.2■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 PKD2Q13563 968 aa25.19■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.18■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.18■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.17■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.15■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 CERKQ8TCT0 537 aa25.14■■□□□ 1.62
VAMP4-204ENST00000482519 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.11■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.11■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 FBXO41Q8TF61 875 aa25.1■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 UNC13BO14795 1591 aa25.09■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.08■■□□□ 1.61
VAMP4-204ENST00000482519 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.06■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 NUP155O75694 1391 aa25.05■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 TET3O43151 1660 aa25.05■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.03■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 IDI1Q13907 227 aa25.03■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 PIK3C2BO00750 1634 aa25.03■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.02■■□□□ 1.6
VAMP4-204ENST00000482519 SYNMO15061 1565 aa25.01■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 NOS1P29475 1434 aa25.01■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.98■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 NAIPQ13075 1403 aa24.97■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.97■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 E9PCH4 1651 aa24.97■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 EID1Q9Y6B2 187 aa24.96■■□□□ 1.59
VAMP4-204ENST00000482519 MED14O60244 1454 aa24.95■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 IQGAP1P46940 1657 aa24.94■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 LTKP29376 864 aa24.94■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.93■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 TRIM52Q96A61 297 aa24.92■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 SLIT1O75093 1534 aa24.91■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.91■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 HFM1A2PYH4 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 ADGRB3O60242 1522 aa24.9■■□□□ 1.58
VAMP4-204ENST00000482519 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.85■■□□□ 1.57
VAMP4-204ENST00000482519 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
VAMP4-204ENST00000482519 BCANQ96GW7 911 aa24.84■■□□□ 1.57
VAMP4-204ENST00000482519 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.82■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.81■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 CPS1P31327 1500 aa24.8■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.79■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.78■■□□□ 1.56
VAMP4-204ENST00000482519 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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