RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 ADGRL2O95490 1459 aa31.99■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.98■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.98■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 ERBINQ96RT1 1412 aa31.97■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.95■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.95■■■□□ 2.71
NELFE-208ENST00000481121 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.95■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 ZMYM3Q14202 1370 aa31.94■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 NCOA1Q15788 1441 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 CEP152O94986 1710 aa31.92■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 DEPDC5O75140 1603 aa31.91■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.9■■■□□ 2.72e-7■■■■□ 20.6
NELFE-208ENST00000481121 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 NPATQ14207 1427 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-208ENST00000481121 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 ABCC3O15438 1527 aa31.86■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.86■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.85■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 PTPRKQ15262 1439 aa31.85■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.84■■■□□ 2.69
NELFE-208ENST00000481121 PZPP20742 1482 aa31.81■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 HSPA2P54652 639 aa31.78■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 ROCK1Q13464 1354 aa31.78■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 ITGAEP38570 1179 aa31.77■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.76■■■□□ 2.68
NELFE-208ENST00000481121 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
NELFE-208ENST00000481121 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
NELFE-208ENST00000481121 KANK1Q14678 1352 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-208ENST00000481121 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.71■■■□□ 2.67
NELFE-208ENST00000481121 UNC13BO14795 1591 aa31.7■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.664e-10■■□□□ 12.8
NELFE-208ENST00000481121 STRCQ7RTU9 1775 aa31.67■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 TNRQ92752 1358 aa31.66■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.66■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.66■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.65■■■□□ 2.66
NELFE-208ENST00000481121 ERVK-7P63135 1459 aa31.63■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.61■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.61■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.61■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 TET3O43151 1660 aa31.59■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 NLRP1Q9C000 1473 aa31.57■■■□□ 2.65
NELFE-208ENST00000481121 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-208ENST00000481121 PLA2R1Q13018 1463 aa31.52■■■□□ 2.64
NELFE-208ENST00000481121 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.51■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 NAIPQ13075 1403 aa31.49■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.47■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 E9PCH4 1651 aa31.46■■■□□ 2.63
NELFE-208ENST00000481121 HFM1A2PYH4 1435 aa31.45■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 SYNMO15061 1565 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 PIK3C2BO00750 1634 aa31.43■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.42■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 NUP155O75694 1391 aa31.41■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 PTPRTO14522 1441 aa31.4■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 NOS1P29475 1434 aa31.39■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
NELFE-208ENST00000481121 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
NELFE-208ENST00000481121 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.34■■■□□ 2.61
NELFE-208ENST00000481121 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.34■■■□□ 2.61
NELFE-208ENST00000481121 PKD2Q13563 968 aa31.34■■■□□ 2.61
NELFE-208ENST00000481121 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.31■■■□□ 2.6
NELFE-208ENST00000481121 ADGRB3O60242 1522 aa31.29■■■□□ 2.6
NELFE-208ENST00000481121 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-208ENST00000481121 IQGAP1P46940 1657 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 SLIT1O75093 1534 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 IDI1Q13907 227 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.22■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 MED14O60244 1454 aa31.21■■■□□ 2.59
NELFE-208ENST00000481121 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.19■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 TRIM52Q96A61 297 aa31.19■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.14■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.14■■■□□ 2.58
NELFE-208ENST00000481121 TRPM2O94759 1503 aa31.12■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.12■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 EID1Q9Y6B2 187 aa31.09■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 CLTCL1P53675 1640 aa31.09■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 KIF1BO60333 1816 aa31.07■■■□□ 2.57
NELFE-208ENST00000481121 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.07■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 CERKQ8TCT0 537 aa31.07■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 LTKP29376 864 aa31.06■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.02■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 ZFYVE9O95405 1425 aa31.01■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
NELFE-208ENST00000481121 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.99■■■□□ 2.55
NELFE-208ENST00000481121 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.98■■■□□ 2.55
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