RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A2MP01023 1474 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPATQ14207 1427 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MLECQ14165 292 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.57□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.56□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSPA2P54652 639 aa8.55□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.55□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FBXO41Q8TF61 875 aa8.54□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CEP152O94986 1710 aa8.54□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.54□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.54□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTPRTO14522 1441 aa8.53□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCOA1Q15788 1441 aa8.53□□□□□ -1.04
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLA2R1Q13018 1463 aa8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTPRKQ15262 1439 aa8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DEPDC5O75140 1603 aa8.51□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 APLP2Q06481 763 aa8.51□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.51□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZMYM3Q14202 1370 aa8.5□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PZPP20742 1482 aa8.5□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MIA2Q96PC5 1412 aa8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.48□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCB7O75027 752 aa8.47□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.47□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC3O15438 1527 aa8.47□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.46□□□□□ -1.05
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CERKQ8TCT0 537 aa8.46□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQGAP1P46940 1657 aa8.46□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP1Q9C000 1473 aa8.45□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.44□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.43□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.43□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GGT6Q6P531 493 aa8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERBINQ96RT1 1412 aa8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYNMO15061 1565 aa8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.42□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MED14O60244 1454 aa8.41□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.41□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TNRQ92752 1358 aa8.41□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.41□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIK3C2BO00750 1634 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CPS1P31327 1500 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERVK-7P63135 1459 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DAPK1P53355 1430 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF3BO15066 747 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PKD2Q13563 968 aa8.4□□□□□ -1.06
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC5O15440 1437 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSPY4P0CV99 314 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSPY10P0CW01 314 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TET3O43151 1660 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.39□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADGRL2O95490 1459 aa8.38□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UNC13BO14795 1591 aa8.38□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLIT1O75093 1534 aa8.38□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.37□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF15Q9NS87 1388 aa8.36□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.36□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.36□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ALKQ9UM73 1620 aa8.36□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.35□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 E9PCH4 1651 aa8.34□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms