RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM66O15016 1216 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBC1D12O60347 775 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 EVI5O60447 810 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDE4DQ08499 809 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP2K5Q13163 448 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 NUTM2FA1L443 756 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC34A2O95436 690 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDX12PQ92771 950 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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ITGB3BP-211ENST00000478538 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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ITGB3BP-211ENST00000478538 FCHSD2O94868 740 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC102AQ96A19 550 aa8.22□□□□□ -1.09
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ITGB3BP-211ENST00000478538 HCSTQ9UBK5 93 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGB3BP-211ENST00000478538 IRF6O14896 467 aa8.19□□□□□ -1.1
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTGDRQ13258 359 aa8.19□□□□□ -1.1
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ITGB3BP-211ENST00000478538 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
ITGB3BP-211ENST00000478538 PHF14O94880 888 aa8.16□□□□□ -1.1
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ITGB3BP-211ENST00000478538 IL27Q8NEV9 243 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.13□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.13□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM117AQ9C073 453 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP3K7O43318 606 aa8.11□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.11□□□□□ -1.11
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ITGB3BP-211ENST00000478538 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.1□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.1□□□□□ -1.11
ITGB3BP-211ENST00000478538 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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ITGB3BP-211ENST00000478538 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZMYND15Q9H091 742 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 FLIIQ13045 1269 aa7.92□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.92□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 NLRP7Q8WX94 980 aa7.92□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.92□□□□□ -1.14
ITGB3BP-211ENST00000478538 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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