RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478336.5

ARF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 930 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-208ENST00000478336 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.77■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 ERBINQ96RT1 1412 aa36.76■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.75■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.74■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.72■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.7■■■■□ 3.47
ARF1-208ENST00000478336 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.68■■■■□ 3.46
ARF1-208ENST00000478336 ZMYM3Q14202 1370 aa36.66■■■■□ 3.46
ARF1-208ENST00000478336 ROCK1Q13464 1354 aa36.65■■■■□ 3.46
ARF1-208ENST00000478336 DEPDC5O75140 1603 aa36.62■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.61■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.58■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 ITGAEP38570 1179 aa36.58■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 ABCC3O15438 1527 aa36.58■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.58■■■■□ 3.45
ARF1-208ENST00000478336 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.57■■■■□ 3.44
ARF1-208ENST00000478336 NPATQ14207 1427 aa36.56■■■■□ 3.44
ARF1-208ENST00000478336 CEP152O94986 1710 aa36.51■■■■□ 3.44
ARF1-208ENST00000478336 PZPP20742 1482 aa36.5■■■■□ 3.43
ARF1-208ENST00000478336 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.47■■■■□ 3.43
ARF1-208ENST00000478336 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.47■■■■□ 3.43
ARF1-208ENST00000478336 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.45■■■■□ 3.43
ARF1-208ENST00000478336 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
ARF1-208ENST00000478336 KANK1Q14678 1352 aa36.4■■■■□ 3.42
ARF1-208ENST00000478336 UNC13BO14795 1591 aa36.4■■■■□ 3.42
ARF1-208ENST00000478336 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.4■■■■□ 3.42
ARF1-208ENST00000478336 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.4■■■■□ 3.42
ARF1-208ENST00000478336 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.35■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.35■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 HSPA2P54652 639 aa36.35■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.33■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 NAIPQ13075 1403 aa36.33■■■■□ 3.41
ARF1-208ENST00000478336 TNRQ92752 1358 aa36.32■■■■□ 3.4
ARF1-208ENST00000478336 ERVK-7P63135 1459 aa36.3■■■■□ 3.4
ARF1-208ENST00000478336 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ARF1-208ENST00000478336 HFM1A2PYH4 1435 aa36.29■■■■□ 3.4
ARF1-208ENST00000478336 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.29■■■■□ 3.4
ARF1-208ENST00000478336 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.24■■■■□ 3.39
ARF1-208ENST00000478336 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.24■■■■□ 3.39
ARF1-208ENST00000478336 TET3O43151 1660 aa36.23■■■■□ 3.39
ARF1-208ENST00000478336 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
ARF1-208ENST00000478336 NLRP1Q9C000 1473 aa36.21■■■■□ 3.39
ARF1-208ENST00000478336 NUP155O75694 1391 aa36.16■■■■□ 3.38
ARF1-208ENST00000478336 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ARF1-208ENST00000478336 STRCQ7RTU9 1775 aa36.15■■■■□ 3.38
ARF1-208ENST00000478336 NOS1P29475 1434 aa36.11■■■■□ 3.37
ARF1-208ENST00000478336 E9PCH4 1651 aa36.1■■■■□ 3.37
ARF1-208ENST00000478336 PLA2R1Q13018 1463 aa36.09■■■■□ 3.37
ARF1-208ENST00000478336 SYNMO15061 1565 aa36.09■■■■□ 3.37
ARF1-208ENST00000478336 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.07■■■■□ 3.37
ARF1-208ENST00000478336 UBR1Q8IWV7 1749 aa36■■■■□ 3.35
ARF1-208ENST00000478336 PIK3C2BO00750 1634 aa35.99■■■■□ 3.35
ARF1-208ENST00000478336 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
ARF1-208ENST00000478336 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 PTPRTO14522 1441 aa35.93■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.93■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.93■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 IDI1Q13907 227 aa35.92■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.91■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 PKD2Q13563 968 aa35.91■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 TRIM52Q96A61 297 aa35.91■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.91■■■■□ 3.34
ARF1-208ENST00000478336 ADGRB3O60242 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
ARF1-208ENST00000478336 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.87■■■■□ 3.33
ARF1-208ENST00000478336 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.87■■■■□ 3.33
ARF1-208ENST00000478336 SLIT1O75093 1534 aa35.85■■■■□ 3.33
ARF1-208ENST00000478336 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.85■■■■□ 3.33
ARF1-208ENST00000478336 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.82■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.81■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.79■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 MED14O60244 1454 aa35.79■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.78■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 TRPM2O94759 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.77■■■■□ 3.32
ARF1-208ENST00000478336 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.75■■■■□ 3.31
ARF1-208ENST00000478336 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ARF1-208ENST00000478336 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ARF1-208ENST00000478336 IQGAP1P46940 1657 aa35.7■■■■□ 3.31
ARF1-208ENST00000478336 CLTCL1P53675 1640 aa35.69■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.69■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 LTKP29376 864 aa35.68■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.66■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 ZFYVE9O95405 1425 aa35.65■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 HRCP23327 699 aa35.64■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 EID1Q9Y6B2 187 aa35.64■■■■□ 3.3
ARF1-208ENST00000478336 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.61■■■■□ 3.29
ARF1-208ENST00000478336 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ARF1-208ENST00000478336 FOXD1Q16676 465 aa35.6■■■■□ 3.29
ARF1-208ENST00000478336 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.59■■■■□ 3.29
ARF1-208ENST00000478336 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
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