RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 A2MP01023 1474 aa38.59■■■■□ 3.77
SOBP-202ENST00000477448 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
SOBP-202ENST00000477448 HRCP23327 699 aa38.56■■■■□ 3.76
SOBP-202ENST00000477448 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.52■■■■□ 3.76
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.51■■■■□ 3.76
SOBP-202ENST00000477448 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
SOBP-202ENST00000477448 GGT6Q6P531 493 aa38.47■■■■□ 3.75
SOBP-202ENST00000477448 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
SOBP-202ENST00000477448 ERBINQ96RT1 1412 aa38.41■■■■□ 3.74
SOBP-202ENST00000477448 KIF3BO15066 747 aa38.38■■■■□ 3.73
SOBP-202ENST00000477448 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
SOBP-202ENST00000477448 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
SOBP-202ENST00000477448 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.33■■■■□ 3.73
SOBP-202ENST00000477448 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
SOBP-202ENST00000477448 C3P01024 1663 aa38.31■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 UNC13BO14795 1591 aa38.3■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.3■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 HSPA2P54652 639 aa38.28■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 ZMYM3Q14202 1370 aa38.28■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
SOBP-202ENST00000477448 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
SOBP-202ENST00000477448 TRIM52Q96A61 297 aa38.25■■■■□ 3.71
SOBP-202ENST00000477448 DEPDC5O75140 1603 aa38.24■■■■□ 3.71
SOBP-202ENST00000477448 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.23■■■■□ 3.71
SOBP-202ENST00000477448 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.22■■■■□ 3.71
SOBP-202ENST00000477448 MROH2AA6NES4 1674 aa38.17■■■■□ 3.7
SOBP-202ENST00000477448 PZPP20742 1482 aa38.17■■■■□ 3.7
SOBP-202ENST00000477448 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
SOBP-202ENST00000477448 NUP155O75694 1391 aa38.14■■■■□ 3.7
SOBP-202ENST00000477448 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.14■■■■□ 3.7
SOBP-202ENST00000477448 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.13■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.13■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.13■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.09■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.09■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.09■■■■□ 3.69
SOBP-202ENST00000477448 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.05■■■■□ 3.68
SOBP-202ENST00000477448 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.684e-6■□□□□ 9.1
SOBP-202ENST00000477448 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
SOBP-202ENST00000477448 NPATQ14207 1427 aa38.04■■■■□ 3.68
SOBP-202ENST00000477448 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.04■■■■□ 3.68
SOBP-202ENST00000477448 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
SOBP-202ENST00000477448 KANK1Q14678 1352 aa37.96■■■■□ 3.67
SOBP-202ENST00000477448 CEP152O94986 1710 aa37.96■■■■□ 3.67
SOBP-202ENST00000477448 TET3O43151 1660 aa37.94■■■■□ 3.66
SOBP-202ENST00000477448 ABCC3O15438 1527 aa37.94■■■■□ 3.66
SOBP-202ENST00000477448 PKD2Q13563 968 aa37.9■■■■□ 3.66
SOBP-202ENST00000477448 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.89■■■■□ 3.66
SOBP-202ENST00000477448 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
SOBP-202ENST00000477448 FOXD1Q16676 465 aa37.87■■■■□ 3.65
SOBP-202ENST00000477448 E9PCH4 1651 aa37.87■■■■□ 3.65
SOBP-202ENST00000477448 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.84■■■■□ 3.65
SOBP-202ENST00000477448 TNRQ92752 1358 aa37.84■■■■□ 3.65
SOBP-202ENST00000477448 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.82■■■■□ 3.64
SOBP-202ENST00000477448 STRCQ7RTU9 1775 aa37.81■■■■□ 3.64
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.81■■■■□ 3.64
SOBP-202ENST00000477448 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.8■■■■□ 3.64
SOBP-202ENST00000477448 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
SOBP-202ENST00000477448 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.73■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.72■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.71■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.71■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 ERVK-7P63135 1459 aa37.7■■■■□ 3.63
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.68■■■■□ 3.62
SOBP-202ENST00000477448 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.66■■■■□ 3.62
SOBP-202ENST00000477448 PLA2R1Q13018 1463 aa37.66■■■■□ 3.62
SOBP-202ENST00000477448 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.66■■■■□ 3.62
SOBP-202ENST00000477448 NEUROD1Q13562 356 aa37.63■■■■□ 3.61
SOBP-202ENST00000477448 PTPRTO14522 1441 aa37.61■■■■□ 3.61
SOBP-202ENST00000477448 NLRP1Q9C000 1473 aa37.61■■■■□ 3.61
SOBP-202ENST00000477448 TRPM2O94759 1503 aa37.61■■■■□ 3.61
SOBP-202ENST00000477448 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.55■■■■□ 3.6
SOBP-202ENST00000477448 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
SOBP-202ENST00000477448 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.54■■■■□ 3.6
SOBP-202ENST00000477448 CLTCL1P53675 1640 aa37.5■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 NOS1P29475 1434 aa37.49■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.47■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 TONSLQ96HA7 1378 aa37.46■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 IDI1Q13907 227 aa37.46■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 SYNMO15061 1565 aa37.45■■■■□ 3.59
SOBP-202ENST00000477448 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.44■■■■□ 3.58
SOBP-202ENST00000477448 PIK3C2BO00750 1634 aa37.4■■■■□ 3.58
SOBP-202ENST00000477448 KIF1BO60333 1816 aa37.4■■■■□ 3.58
SOBP-202ENST00000477448 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.4■■■■□ 3.58
SOBP-202ENST00000477448 CERKQ8TCT0 537 aa37.4■■■■□ 3.58
SOBP-202ENST00000477448 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.37■■■■□ 3.57
SOBP-202ENST00000477448 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.36■■■■□ 3.57
SOBP-202ENST00000477448 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
SOBP-202ENST00000477448 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
SOBP-202ENST00000477448 LTKP29376 864 aa37.31■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.31■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.31■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.3■■■■□ 3.56
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