RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477091.5

MRPS6-202, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S6, humanhuman

TSL 5

Gene MRPS6, Length 1,061 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS6-202ENST00000477091 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 LMTK3Q96Q04 1460 aa27■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 ZMYM3Q14202 1370 aa26.98■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.97■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.97■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.97■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 ERBINQ96RT1 1412 aa26.96■■□□□ 1.91
MRPS6-202ENST00000477091 ADGRL2O95490 1459 aa26.94■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.93■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 NPATQ14207 1427 aa26.93■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.93■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 NCOA1Q15788 1441 aa26.92■■□□□ 1.9
MRPS6-202ENST00000477091 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.94e-9■■■□□ 14.8
MRPS6-202ENST00000477091 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.87■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 CEP152O94986 1710 aa26.85■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 PTPRKQ15262 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 DEPDC5O75140 1603 aa26.85■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 ABCC3O15438 1527 aa26.85■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 HSPA2P54652 639 aa26.83■■□□□ 1.89
MRPS6-202ENST00000477091 PZPP20742 1482 aa26.82■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.82■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 ITGAEP38570 1179 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 ROCK1Q13464 1354 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 KANK1Q14678 1352 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.8■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.79■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
MRPS6-202ENST00000477091 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
MRPS6-202ENST00000477091 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
MRPS6-202ENST00000477091 TNRQ92752 1358 aa26.73■■□□□ 1.87
MRPS6-202ENST00000477091 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
MRPS6-202ENST00000477091 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.7■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 STRCQ7RTU9 1775 aa26.69■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.68■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.68■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.68■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.67■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 UNC13BO14795 1591 aa26.67■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 ERVK-7P63135 1459 aa26.66■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 NLRP1Q9C000 1473 aa26.66■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.64■■□□□ 1.86
MRPS6-202ENST00000477091 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.61■■□□□ 1.85
MRPS6-202ENST00000477091 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.61■■□□□ 1.85
MRPS6-202ENST00000477091 TET3O43151 1660 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPS6-202ENST00000477091 PLA2R1Q13018 1463 aa26.59■■□□□ 1.85
MRPS6-202ENST00000477091 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.58■■□□□ 1.85
MRPS6-202ENST00000477091 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.57■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 PKD2Q13563 968 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 PTPRTO14522 1441 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 NAIPQ13075 1403 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPS6-202ENST00000477091 NUP155O75694 1391 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 HFM1A2PYH4 1435 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 E9PCH4 1651 aa26.48■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 NOS1P29475 1434 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 PIK3C2BO00750 1634 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 SYNMO15061 1565 aa26.46■■□□□ 1.83
MRPS6-202ENST00000477091 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
MRPS6-202ENST00000477091 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.43■■□□□ 1.82
MRPS6-202ENST00000477091 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.43■■□□□ 1.82
MRPS6-202ENST00000477091 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPS6-202ENST00000477091 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.38■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 IDI1Q13907 227 aa26.37■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 ADGRB3O60242 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 TRIM52Q96A61 297 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 SLIT1O75093 1534 aa26.35■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.35■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 IQGAP1P46940 1657 aa26.34■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 MED14O60244 1454 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPS6-202ENST00000477091 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 EID1Q9Y6B2 187 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.3■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 CERKQ8TCT0 537 aa26.28■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.27■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.27■■□□□ 1.8
MRPS6-202ENST00000477091 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.25■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.24■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 LTKP29376 864 aa26.22■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 TRPM2O94759 1503 aa26.2■■□□□ 1.79
MRPS6-202ENST00000477091 FBXO41Q8TF61 875 aa26.2■■□□□ 1.78
MRPS6-202ENST00000477091 KIF1BO60333 1816 aa26.18■■□□□ 1.78
MRPS6-202ENST00000477091 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MRPS6-202ENST00000477091 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.17■■□□□ 1.78
MRPS6-202ENST00000477091 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms