RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KANK1Q14678 1352 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZMYM3Q14202 1370 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTPRMP28827 1452 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HFM1A2PYH4 1435 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NAIPQ13075 1403 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MADDQ8WXG6 1647 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HRCP23327 699 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUP155O75694 1391 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MROH2AA6NES4 1674 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DEPDC5O75140 1603 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRIM52Q96A61 297 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC3O15438 1527 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPATQ14207 1427 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C3P01024 1663 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UNC13BO14795 1591 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PZPP20742 1482 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CEP152O94986 1710 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNRQ92752 1358 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TET3O43151 1660 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PKD2Q13563 968 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERVK-7P63135 1459 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NOS1P29475 1434 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NLRP1Q9C000 1473 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-208ENST00000476204 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IDI1Q13907 227 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-208ENST00000476204 E9PCH4 1651 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTPRTO14522 1441 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HSPA2P54652 639 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FOXD1Q16676 465 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SYNMO15061 1565 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EID1Q9Y6B2 187 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLA2R1Q13018 1463 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRPM2O94759 1503 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIK3C2BO00750 1634 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRB3O60242 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLIT1O75093 1534 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LTKP29376 864 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF1BO60333 1816 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLTCL1P53675 1640 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms