RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472004.5

GYS1-204, Transcript of glycogen synthase 1, human

TSL 3

Gene GYS1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYS1-204	ENST00000472004	NUP155	O75694	1391 aa		21.1	■□□□□ 0.97
GYS1-204	ENST00000472004	GGT6	Q6P531	493 aa		21.08	■□□□□ 0.97
GYS1-204	ENST00000472004	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
GYS1-204	ENST00000472004	UNC13B	O14795	1591 aa		21.03	■□□□□ 0.96
GYS1-204	ENST00000472004	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	21.03	■□□□□ 0.96
GYS1-204	ENST00000472004	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
GYS1-204	ENST00000472004	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		21.02	■□□□□ 0.96
GYS1-204	ENST00000472004	RERE	Q9P2R6	1566 aa		21.02	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	MLEC	Q14165	292 aa		21.01	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		20.98	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	20.97	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	AGL	P35573	1532 aa		20.97	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		20.97	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	DEPDC5	O75140	1603 aa		20.96	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		20.96	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	PKD2	Q13563	968 aa		20.96	■□□□□ 0.95
GYS1-204	ENST00000472004	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		20.95	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	20.95	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		20.95	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	PZP	P20742	1482 aa		20.94	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	FOXD1	Q16676	465 aa		20.91	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		20.91	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		20.91	■□□□□ 0.94
GYS1-204	ENST00000472004	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		20.89	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	CEP152	O94986	1710 aa		20.88	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	TET3	O43151	1660 aa		20.87	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	NEUROD1	Q13562	356 aa		20.87	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		20.86	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		20.85	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	ABCC3	O15438	1527 aa		20.85	■□□□□ 0.93
GYS1-204	ENST00000472004	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		20.83	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		20.82	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	20.81	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		20.81	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		20.79	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		20.79	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004		E9PCH4	1651 aa		20.79	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GYS1-204	ENST00000472004	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		20.77	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	TONSL	Q96HA7	1378 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	NPAT	Q14207	1427 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	ZMYM3	Q14202	1370 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GYS1-204	ENST00000472004	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	MROH2A	A6NES4	1674 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	TRPM2	O94759	1503 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	MADD	Q8WXG6	1647 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	20.67	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	PTPRT	O14522	1441 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GYS1-204	ENST00000472004	ERVK-7	P63135	1459 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	PLA2R1	Q13018	1463 aa		20.63	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	20.63	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	RGL3	Q3MIN7	710 aa		20.63	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		20.63	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		20.62	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	NOS1	P29475	1434 aa		20.61	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	TNR	Q92752	1358 aa		20.61	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	CLTCL1	P53675	1640 aa		20.61	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	C3	P01024	1663 aa		20.6	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		20.59	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	KIF1B	O60333	1816 aa		20.58	■□□□□ 0.89
GYS1-204	ENST00000472004	SYNM	O15061	1565 aa		20.58	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		20.58	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		20.56	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		20.56	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	IDI1	Q13907	227 aa		20.55	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		20.55	■□□□□ 0.88
GYS1-204	ENST00000472004	PTPRM	P28827	1452 aa		20.51	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	PIK3C2B	O00750	1634 aa		20.51	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	NLRP1	Q9C000	1473 aa		20.5	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		20.48	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	20.48	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	ADGRB3	O60242	1522 aa		20.48	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		20.47	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
GYS1-204	ENST00000472004	STAC3	Q96MF2	364 aa		20.45	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		20.45	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		20.43	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		20.42	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		20.42	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	20.42	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	BCAN	Q96GW7	911 aa		20.41	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		20.41	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		20.4	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	20.4	■□□□□ 0.86
GYS1-204	ENST00000472004	EID1	Q9Y6B2	187 aa		20.39	■□□□□ 0.85

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