RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471664.1

GLIS3-210, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,569 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-210ENST00000471664 KIF3BO15066 747 aa19.06■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.06■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 TNRQ92752 1358 aa19.04■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.03■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 TIAM1Q13009 1591 aa19.03■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.03■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.02■□□□□ 0.64
GLIS3-210ENST00000471664 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 CPS1P31327 1500 aa19■□□□□ 0.63
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GLIS3-210ENST00000471664 CEP162Q5TB80 1403 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 MIA2Q96PC5 1412 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS3-210ENST00000471664 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.94■□□□□ 0.62
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GLIS3-210ENST00000471664 TSPY10P0CW01 314 aa18.93■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.93■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.92■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.92■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.91■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 NLRP1Q9C000 1473 aa18.91■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 MED14O60244 1454 aa18.91■□□□□ 0.62
GLIS3-210ENST00000471664 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
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GLIS3-210ENST00000471664 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
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GLIS3-210ENST00000471664 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.77■□□□□ 0.6
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GLIS3-210ENST00000471664 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.74■□□□□ 0.59
GLIS3-210ENST00000471664 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.73■□□□□ 0.59
GLIS3-210ENST00000471664 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.73■□□□□ 0.59
GLIS3-210ENST00000471664 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
GLIS3-210ENST00000471664 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
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GLIS3-210ENST00000471664 CEP152O94986 1710 aa18.72■□□□□ 0.59
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GLIS3-210ENST00000471664 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.67■□□□□ 0.58
GLIS3-210ENST00000471664 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.65■□□□□ 0.58
GLIS3-210ENST00000471664 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.64■□□□□ 0.58
GLIS3-210ENST00000471664 KIF15Q9NS87 1388 aa18.64■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.64■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.63■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.62■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 KCNA6P17658 529 aa18.62■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 IDI1Q13907 227 aa18.62■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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GLIS3-210ENST00000471664 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
GLIS3-210ENST00000471664 ABCC5O15440 1437 aa18.59■□□□□ 0.57
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GLIS3-210ENST00000471664 MAP3K1Q13233 1512 aa18.58■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 BCANQ96GW7 911 aa18.55■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.55■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.54■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 TET3O43151 1660 aa18.54■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.54■□□□□ 0.56
GLIS3-210ENST00000471664 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.52■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.52■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 SLAIN2Q9P270 581 aa18.51■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 DAPK1P53355 1430 aa18.51■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 APLP2Q06481 763 aa18.5■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.5■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.5■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.49■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 MSH6P52701 1360 aa18.49■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 NOS1P29475 1434 aa18.47■□□□□ 0.55
GLIS3-210ENST00000471664 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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