RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
LINC00888-201ENST00000468380 KIF3BO15066 747 aa30.28■■■□□ 2.44
LINC00888-201ENST00000468380 TNRQ92752 1358 aa30.28■■■□□ 2.44
LINC00888-201ENST00000468380 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.25■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 TOM1O60784 492 aa30.24■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.24■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.21■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 CPS1P31327 1500 aa30.21■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 PZPP20742 1482 aa30.2■■■□□ 2.43
LINC00888-201ENST00000468380 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.19■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 CEP162Q5TB80 1403 aa30.18■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 MIA2Q96PC5 1412 aa30.16■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.15■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.14■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.14■■■□□ 2.42
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.12■■■□□ 2.41
LINC00888-201ENST00000468380 ALKQ9UM73 1620 aa30.11■■■□□ 2.41
LINC00888-201ENST00000468380 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.1■■■□□ 2.41
LINC00888-201ENST00000468380 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
LINC00888-201ENST00000468380 MED14O60244 1454 aa30.09■■■□□ 2.41
LINC00888-201ENST00000468380 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.07■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.07■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.07■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 NLRP1Q9C000 1473 aa30.07■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 NCOA2Q15596 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 DEPDC5O75140 1603 aa30.03■■■□□ 2.4
LINC00888-201ENST00000468380 TSPY4P0CV99 314 aa30■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 TSPY10P0CW01 314 aa30■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.98■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.96■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 IQGAP1P46940 1657 aa29.95■■■□□ 2.39
LINC00888-201ENST00000468380 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.94■■■□□ 2.38
LINC00888-201ENST00000468380 ABCC3O15438 1527 aa29.92■■■□□ 2.38
LINC00888-201ENST00000468380 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
LINC00888-201ENST00000468380 ERVK-7P63135 1459 aa29.88■■■□□ 2.37
LINC00888-201ENST00000468380 LTKP29376 864 aa29.86■■■□□ 2.37
LINC00888-201ENST00000468380 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
LINC00888-201ENST00000468380 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
LINC00888-201ENST00000468380 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.82■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.81■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.8■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 SYNMO15061 1565 aa29.79■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
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LINC00888-201ENST00000468380 CEP152O94986 1710 aa29.75■■■□□ 2.35
LINC00888-201ENST00000468380 SLIT1O75093 1534 aa29.72■■■□□ 2.35
LINC00888-201ENST00000468380 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.68■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.67■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 EID1Q9Y6B2 187 aa29.67■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.64■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.64■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.64■■■□□ 2.34
LINC00888-201ENST00000468380 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.63■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.63■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 POTEAQ6S8J7 498 aa29.62■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 KIF15Q9NS87 1388 aa29.61■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM94Q12767 1356 aa29.6■■■□□ 2.33
LINC00888-201ENST00000468380 IDI1Q13907 227 aa29.59■■■□□ 2.33
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LINC00888-201ENST00000468380 PIK3C2BO00750 1634 aa29.59■■■□□ 2.33
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LINC00888-201ENST00000468380 KCNA6P17658 529 aa29.57■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.57■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 ERBINQ96RT1 1412 aa29.55■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.55■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 MAP3K1Q13233 1512 aa29.54■■■□□ 2.32
LINC00888-201ENST00000468380 TET3O43151 1660 aa29.51■■■□□ 2.31
LINC00888-201ENST00000468380 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.49■■■□□ 2.31
LINC00888-201ENST00000468380 KANK1Q14678 1352 aa29.47■■■□□ 2.31
LINC00888-201ENST00000468380 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.47■■■□□ 2.31
LINC00888-201ENST00000468380 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.44■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 DAPK1P53355 1430 aa29.44■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.44■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.43■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.42■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 NOS1P29475 1434 aa29.41■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 SLAIN2Q9P270 581 aa29.4■■■□□ 2.3
LINC00888-201ENST00000468380 BCANQ96GW7 911 aa29.36■■■□□ 2.29
LINC00888-201ENST00000468380 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.36■■■□□ 2.29
LINC00888-201ENST00000468380 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
LINC00888-201ENST00000468380 MSH6P52701 1360 aa29.35■■■□□ 2.29
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.35■■■□□ 2.29
LINC00888-201ENST00000468380 NWD1Q149M9 1564 aa29.35■■■□□ 2.29
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