RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467837.5

NCSTN-211, Transcript of nicastrin, humanhuman

TSL 5

Gene NCSTN, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTN-211ENST00000467837 MLECQ14165 292 aa24.71■■□□□ 1.55
NCSTN-211ENST00000467837 MROH2AA6NES4 1674 aa24.69■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 PTPRMP28827 1452 aa24.69■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.69■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 KIF3BO15066 747 aa24.67■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.66■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 HFM1A2PYH4 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 UNC13BO14795 1591 aa24.65■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.65■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 NAIPQ13075 1403 aa24.64■■□□□ 1.54
NCSTN-211ENST00000467837 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.63■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 C3P01024 1663 aa24.63■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 ABCC3O15438 1527 aa24.62■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 CEP152O94986 1710 aa24.61■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 GGT6Q6P531 493 aa24.61■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.61■■□□□ 1.53
NCSTN-211ENST00000467837 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.56■■□□□ 1.52
NCSTN-211ENST00000467837 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.56■■□□□ 1.52
NCSTN-211ENST00000467837 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.53■■□□□ 1.52
NCSTN-211ENST00000467837 ZMYM3Q14202 1370 aa24.51■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 PZPP20742 1482 aa24.51■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.5■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 TET3O43151 1660 aa24.49■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 KANK1Q14678 1352 aa24.47■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.46■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 NPATQ14207 1427 aa24.45■■□□□ 1.51
NCSTN-211ENST00000467837 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.44■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.42■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.41■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.41■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 E9PCH4 1651 aa24.4■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 ERVK-7P63135 1459 aa24.39■■□□□ 1.5
NCSTN-211ENST00000467837 NUP155O75694 1391 aa24.39■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.37■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.37■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.35■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NCSTN-211ENST00000467837 SYNMO15061 1565 aa24.33■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 TNRQ92752 1358 aa24.31■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 NOS1P29475 1434 aa24.31■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.31■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 NLRP1Q9C000 1473 aa24.27■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.27■■□□□ 1.48
NCSTN-211ENST00000467837 PIK3C2BO00750 1634 aa24.25■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.25■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 HRCP23327 699 aa24.22■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 TRIM52Q96A61 297 aa24.22■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 PTPRTO14522 1441 aa24.21■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 TRPM2O94759 1503 aa24.2■■□□□ 1.47
NCSTN-211ENST00000467837 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.2■■□□□ 1.46
NCSTN-211ENST00000467837 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.19■■□□□ 1.46
NCSTN-211ENST00000467837 PLA2R1Q13018 1463 aa24.16■■□□□ 1.46
NCSTN-211ENST00000467837 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NCSTN-211ENST00000467837 ADGRB3O60242 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
NCSTN-211ENST00000467837 PKD2Q13563 968 aa24.14■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 CLTCL1P53675 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.13■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 STRCQ7RTU9 1775 aa24.12■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.11■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 HSPA2P54652 639 aa24.11■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.11■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.1■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 IDI1Q13907 227 aa24.08■■□□□ 1.45
NCSTN-211ENST00000467837 SLIT1O75093 1534 aa24.07■■□□□ 1.44
NCSTN-211ENST00000467837 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.07■■□□□ 1.44
NCSTN-211ENST00000467837 FOXD1Q16676 465 aa24.05■■□□□ 1.44
NCSTN-211ENST00000467837 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.04■■□□□ 1.44
NCSTN-211ENST00000467837 KIF1BO60333 1816 aa24.03■■□□□ 1.44
NCSTN-211ENST00000467837 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
NCSTN-211ENST00000467837 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.98■■□□□ 1.43
NCSTN-211ENST00000467837 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.98■■□□□ 1.43
NCSTN-211ENST00000467837 ZFYVE9O95405 1425 aa23.98■■□□□ 1.43
NCSTN-211ENST00000467837 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.97■■□□□ 1.43
NCSTN-211ENST00000467837 MED14O60244 1454 aa23.95■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.95■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.93■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 IQGAP1P46940 1657 aa23.92■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.92■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.92■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.9■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.9■■□□□ 1.42
NCSTN-211ENST00000467837 IFT172Q9UG01 1749 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms