RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.42□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RICTORQ6R327 1708 aa9.42□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.42□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.41□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.4□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.4□□□□□ -0.9
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERBINQ96RT1 1412 aa9.4□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUP155O75694 1391 aa9.39□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.39□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.39□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIF3BO15066 747 aa9.38□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABCA6Q8N139 1617 aa9.38□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.37□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A2MP01023 1474 aa9.37□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PZPP20742 1482 aa9.37□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.36□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.36□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.36□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEUROD1Q13562 356 aa9.36□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.36□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PKD2Q13563 968 aa9.35□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UNC13BO14795 1591 aa9.35□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.34□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.34□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.34□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GGT6Q6P531 493 aa9.34□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KANK1Q14678 1352 aa9.33□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP10AO60312 1499 aa9.32□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.32□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DEPDC5O75140 1603 aa9.32□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC4A2P04920 1241 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MLECQ14165 292 aa9.27□□□□□ -0.92
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 REREQ9P2R6 1566 aa9.27□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TONSLQ96HA7 1378 aa9.27□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CEP152O94986 1710 aa9.27□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TET3O43151 1660 aa9.26□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.26□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 E9PCH4 1651 aa9.26□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AGLP35573 1532 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC24A1O60721 1099 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABCC3O15438 1527 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLA2R1Q13018 1463 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.22□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NPATQ14207 1427 aa9.22□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.22□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.22□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBTB22O15209 634 aa9.21□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RGL3Q3MIN7 710 aa9.21□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRPM2O94759 1503 aa9.2□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PTPRTO14522 1441 aa9.2□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.18□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.18□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.18□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLTCL1P53675 1640 aa9.18□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.17□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.17□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZMYM3Q14202 1370 aa9.16□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NOS1P29475 1434 aa9.16□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.15□□□□□ -0.94
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIF1BO60333 1816 aa9.15□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYNMO15061 1565 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERVK-7P63135 1459 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF39Q9H2S5 420 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.14□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IDI1Q13907 227 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms