RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.65■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 GGT6Q6P531 493 aa25.65■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
USP39-211ENST00000465282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.63■■□□□ 1.69
USP39-211ENST00000465282 MROH2AA6NES4 1674 aa25.61■■□□□ 1.69
USP39-211ENST00000465282 PTPRMP28827 1452 aa25.61■■□□□ 1.69
USP39-211ENST00000465282 DEPDC5O75140 1603 aa25.6■■□□□ 1.69
USP39-211ENST00000465282 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.56■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.56■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.55■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 HFM1A2PYH4 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.53■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 C3P01024 1663 aa25.52■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 KANK1Q14678 1352 aa25.52■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 NAIPQ13075 1403 aa25.52■■□□□ 1.68
USP39-211ENST00000465282 ZMYM3Q14202 1370 aa25.5■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 UNC13BO14795 1591 aa25.48■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 ABCC3O15438 1527 aa25.48■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.48■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 CEP152O94986 1710 aa25.46■■□□□ 1.67
USP39-211ENST00000465282 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.661e-7■□□□□ 9.9
USP39-211ENST00000465282 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.44■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 NPATQ14207 1427 aa25.43■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.42■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 PZPP20742 1482 aa25.4■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.39■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.39■■□□□ 1.66
USP39-211ENST00000465282 TET3O43151 1660 aa25.36■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 NUP155O75694 1391 aa25.36■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.36■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.36■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.36■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.33■■□□□ 1.65
USP39-211ENST00000465282 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.3■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 HRCP23327 699 aa25.28■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.28■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 TNRQ92752 1358 aa25.27■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 ERVK-7P63135 1459 aa25.27■■□□□ 1.64
USP39-211ENST00000465282 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 E9PCH4 1651 aa25.25■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.24■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.24■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.23■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 NLRP1Q9C000 1473 aa25.22■■□□□ 1.63
USP39-211ENST00000465282 NOS1P29475 1434 aa25.2■■□□□ 1.62
USP39-211ENST00000465282 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP39-211ENST00000465282 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP39-211ENST00000465282 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
USP39-211ENST00000465282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.15■■□□□ 1.62
USP39-211ENST00000465282 SYNMO15061 1565 aa25.14■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.13■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.12■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 PKD2Q13563 968 aa25.11■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 PTPRTO14522 1441 aa25.1■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.1■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 PIK3C2BO00750 1634 aa25.08■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
USP39-211ENST00000465282 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.07■■□□□ 1.6
USP39-211ENST00000465282 IDI1Q13907 227 aa25.06■■□□□ 1.6
USP39-211ENST00000465282 HSPA2P54652 639 aa25.05■■□□□ 1.6
USP39-211ENST00000465282 TRPM2O94759 1503 aa25.05■■□□□ 1.6
USP39-211ENST00000465282 PLA2R1Q13018 1463 aa25.04■■□□□ 1.6
USP39-211ENST00000465282 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.01■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 ADGRB3O60242 1522 aa25■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 STRCQ7RTU9 1775 aa24.99■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.98■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 KIF1BO60333 1816 aa24.97■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 SLIT1O75093 1534 aa24.96■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
USP39-211ENST00000465282 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.95■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.95■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 CLTCL1P53675 1640 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 FOXD1Q16676 465 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.92■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.91■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.89■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 EID1Q9Y6B2 187 aa24.89■■□□□ 1.58
USP39-211ENST00000465282 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.87■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 MED14O60244 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.86■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.85■■□□□ 1.57
USP39-211ENST00000465282 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms