RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465125.1

RERE-208, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 5

Gene RERE, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-208ENST00000465125 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.61■■■■□ 3.45
RERE-208ENST00000465125 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
RERE-208ENST00000465125 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.59■■■■□ 3.45
RERE-208ENST00000465125 UNC13BO14795 1591 aa36.58■■■■□ 3.45
RERE-208ENST00000465125 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.56■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 MADDQ8WXG6 1647 aa36.55■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.54■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.443e-10■□□□□ 9.1
RERE-208ENST00000465125 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.54■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 KANK1Q14678 1352 aa36.53■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.52■■■■□ 3.44
RERE-208ENST00000465125 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.51■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.48■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.47■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 ABCC3O15438 1527 aa36.46■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.46■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 CEP152O94986 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.45■■■■□ 3.43
RERE-208ENST00000465125 NUP155O75694 1391 aa36.44■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.43■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 MROH2AA6NES4 1674 aa36.42■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.41■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 TRIM52Q96A61 297 aa36.41■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.39■■■■□ 3.42
RERE-208ENST00000465125 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.37■■■■□ 3.41
RERE-208ENST00000465125 HRCP23327 699 aa36.36■■■■□ 3.41
RERE-208ENST00000465125 TET3O43151 1660 aa36.34■■■■□ 3.41
RERE-208ENST00000465125 PTPRMP28827 1452 aa36.31■■■■□ 3.4
RERE-208ENST00000465125 ZMYM3Q14202 1370 aa36.3■■■■□ 3.4
RERE-208ENST00000465125 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.3■■■■□ 3.4
RERE-208ENST00000465125 C3P01024 1663 aa36.29■■■■□ 3.4
RERE-208ENST00000465125 PZPP20742 1482 aa36.29■■■■□ 3.4
RERE-208ENST00000465125 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.25■■■■□ 3.39
RERE-208ENST00000465125 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.22■■■■□ 3.39
RERE-208ENST00000465125 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
RERE-208ENST00000465125 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
RERE-208ENST00000465125 NPATQ14207 1427 aa36.21■■■■□ 3.39
RERE-208ENST00000465125 E9PCH4 1651 aa36.19■■■■□ 3.38
RERE-208ENST00000465125 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
RERE-208ENST00000465125 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.16■■■■□ 3.38
RERE-208ENST00000465125 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.13■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 ERVK-7P63135 1459 aa36.13■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 PKD2Q13563 968 aa36.13■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.1■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
RERE-208ENST00000465125 TNRQ92752 1358 aa36.05■■■■□ 3.36
RERE-208ENST00000465125 NOS1P29475 1434 aa36.04■■■■□ 3.36
RERE-208ENST00000465125 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.03■■■■□ 3.36
RERE-208ENST00000465125 FOXD1Q16676 465 aa36■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 SYNMO15061 1565 aa36■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 PTPRTO14522 1441 aa35.98■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.97■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 TRPM2O94759 1503 aa35.96■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
RERE-208ENST00000465125 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
RERE-208ENST00000465125 NLRP1Q9C000 1473 aa35.92■■■■□ 3.34
RERE-208ENST00000465125 PLA2R1Q13018 1463 aa35.91■■■■□ 3.34
RERE-208ENST00000465125 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.91■■■■□ 3.34
RERE-208ENST00000465125 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
RERE-208ENST00000465125 PIK3C2BO00750 1634 aa35.88■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.88■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.87■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.85■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 CLTCL1P53675 1640 aa35.84■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.83■■■■□ 3.33
RERE-208ENST00000465125 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.82■■■■□ 3.32
RERE-208ENST00000465125 IDI1Q13907 227 aa35.81■■■■□ 3.32
RERE-208ENST00000465125 ADGRB3O60242 1522 aa35.78■■■■□ 3.32
RERE-208ENST00000465125 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.76■■■■□ 3.32
RERE-208ENST00000465125 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.74■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.74■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 KIF1BO60333 1816 aa35.72■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.71■■■■□ 3.31
RERE-208ENST00000465125 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.65■■■■□ 3.3
RERE-208ENST00000465125 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
RERE-208ENST00000465125 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
RERE-208ENST00000465125 HSPA2P54652 639 aa35.59■■■■□ 3.29
RERE-208ENST00000465125 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.59■■■■□ 3.29
RERE-208ENST00000465125 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.58■■■■□ 3.29
RERE-208ENST00000465125 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.57■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 SLIT1O75093 1534 aa35.56■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.55■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.54■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.54■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.51■■■■□ 3.28
RERE-208ENST00000465125 NEUROD1Q13562 356 aa35.5■■■■□ 3.27
RERE-208ENST00000465125 RGL3Q3MIN7 710 aa35.5■■■■□ 3.27
RERE-208ENST00000465125 ZFYVE9O95405 1425 aa35.49■■■■□ 3.27
RERE-208ENST00000465125 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.47■■■■□ 3.27
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