RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
IL6-208	ENST00000464710	NAIP	Q13075	1403 aa		12.41	□□□□□ -0.42
IL6-208	ENST00000464710	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
IL6-208	ENST00000464710	NUP155	O75694	1391 aa		12.4	□□□□□ -0.42
IL6-208	ENST00000464710	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.39	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	HFM1	A2PYH4	1435 aa		12.39	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		12.37	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12.37	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		12.36	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		12.35	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	HRC	P23327	699 aa		12.35	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		12.34	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.34	□□□□□ -0.43
IL6-208	ENST00000464710	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	PKD2	Q13563	968 aa		12.32	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	MADD	Q8WXG6	1647 aa		12.3	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12.3	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	PTPRM	P28827	1452 aa		12.3	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	FOXD1	Q16676	465 aa		12.3	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		12.29	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		12.29	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.28	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		12.28	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	ABCC3	O15438	1527 aa		12.27	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.44
IL6-208	ENST00000464710	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		12.26	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		12.25	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	UNC13B	O14795	1591 aa		12.24	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	DEPDC5	O75140	1603 aa		12.24	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	CEP152	O94986	1710 aa		12.24	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	TNR	Q92752	1358 aa		12.24	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		12.23	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	NPAT	Q14207	1427 aa		12.23	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		12.23	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	IDI1	Q13907	227 aa		12.23	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		12.22	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	PZP	P20742	1482 aa		12.22	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		12.22	□□□□□ -0.45
IL6-208	ENST00000464710	C3	P01024	1663 aa		12.2	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		12.2	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		12.2	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.19	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	HSPA2	P54652	639 aa		12.19	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	ERVK-7	P63135	1459 aa		12.19	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	TET3	O43151	1660 aa		12.19	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	NEUROD1	Q13562	356 aa		12.18	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		12.18	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		12.17	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	RGL3	Q3MIN7	710 aa		12.17	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	NOS1	P29475	1434 aa		12.16	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710		E9PCH4	1651 aa		12.16	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.15	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		12.15	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
IL6-208	ENST00000464710	PTPRT	O14522	1441 aa		12.14	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	EID1	Q9Y6B2	187 aa		12.14	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	NLRP1	Q9C000	1473 aa		12.13	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.12	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.12	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		12.11	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		12.11	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		12.1	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	SYNM	O15061	1565 aa		12.09	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47
IL6-208	ENST00000464710	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		12.08	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	LTK	P29376	864 aa		12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		12.07	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	TRPM2	O94759	1503 aa		12.06	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		12.06	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	PIK3C2B	O00750	1634 aa		12.06	□□□□□ -0.48
IL6-208	ENST00000464710	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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