RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 MROH2AA6NES4 1674 aa31.49■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 C3P01024 1663 aa31.48■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 ROCK1Q13464 1354 aa31.48■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.46■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 ITGAEP38570 1179 aa31.46■■■□□ 2.63
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.44■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.43■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 ZMYM3Q14202 1370 aa31.43■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.41■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 DEPDC5O75140 1603 aa31.41■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.39■■■□□ 2.62
RPUSD3-210ENST00000460909 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
RPUSD3-210ENST00000460909 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.37■■■□□ 2.61
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC3O15438 1527 aa31.35■■■□□ 2.61
RPUSD3-210ENST00000460909 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
RPUSD3-210ENST00000460909 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 CEP152O94986 1710 aa31.3■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.3■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 NPATQ14207 1427 aa31.3■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.29■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.28■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 PZPP20742 1482 aa31.27■■■□□ 2.6
RPUSD3-210ENST00000460909 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.24■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 NAIPQ13075 1403 aa31.23■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 UNC13BO14795 1591 aa31.22■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 KANK1Q14678 1352 aa31.22■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.22■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.21■■■□□ 2.59
RPUSD3-210ENST00000460909 HFM1A2PYH4 1435 aa31.19■■■□□ 2.58
RPUSD3-210ENST00000460909 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.18■■■□□ 2.58
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.17■■■□□ 2.58
RPUSD3-210ENST00000460909 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.13■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.12■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 HSPA2P54652 639 aa31.11■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 TNRQ92752 1358 aa31.11■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.1■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.1■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 ERVK-7P63135 1459 aa31.1■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
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RPUSD3-210ENST00000460909 TET3O43151 1660 aa31.08■■■□□ 2.57
RPUSD3-210ENST00000460909 NUP155O75694 1391 aa31.05■■■□□ 2.56
RPUSD3-210ENST00000460909 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
RPUSD3-210ENST00000460909 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.01■■■□□ 2.56
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RPUSD3-210ENST00000460909 E9PCH4 1651 aa30.98■■■□□ 2.55
RPUSD3-210ENST00000460909 NOS1P29475 1434 aa30.98■■■□□ 2.55
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RPUSD3-210ENST00000460909 STRCQ7RTU9 1775 aa30.94■■■□□ 2.54
RPUSD3-210ENST00000460909 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.91■■■□□ 2.54
RPUSD3-210ENST00000460909 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.89■■■□□ 2.54
RPUSD3-210ENST00000460909 PLA2R1Q13018 1463 aa30.88■■■□□ 2.53
RPUSD3-210ENST00000460909 TRIM52Q96A61 297 aa30.87■■■□□ 2.53
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RPUSD3-210ENST00000460909 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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RPUSD3-210ENST00000460909 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
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RPUSD3-210ENST00000460909 LTKP29376 864 aa30.62■■■□□ 2.49
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RPUSD3-210ENST00000460909 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
RPUSD3-210ENST00000460909 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.58■■■□□ 2.49
RPUSD3-210ENST00000460909 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 ZFYVE9O95405 1425 aa30.56■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 IQGAP1P46940 1657 aa30.55■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 EID1Q9Y6B2 187 aa30.55■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.52■■■□□ 2.48
RPUSD3-210ENST00000460909 KIF1BO60333 1816 aa30.52■■■□□ 2.48
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