RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 ZMYM3Q14202 1370 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 MROH2AA6NES4 1674 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-206ENST00000443528 ERBINQ96RT1 1412 aa24.08■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 ITGAEP38570 1179 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-206ENST00000443528 ROCK1Q13464 1354 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 NPATQ14207 1427 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 ABCC3O15438 1527 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 DEPDC5O75140 1603 aa23.95■■□□□ 1.43
ACTB-206ENST00000443528 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 HSPA2P54652 639 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 PZPP20742 1482 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 CEP152O94986 1710 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-206ENST00000443528 KANK1Q14678 1352 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 TNRQ92752 1358 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-206ENST00000443528 UNC13BO14795 1591 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 ERVK-7P63135 1459 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 NAIPQ13075 1403 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-206ENST00000443528 HFM1A2PYH4 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 NLRP1Q9C000 1473 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 NUP155O75694 1391 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 STRCQ7RTU9 1775 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 TET3O43151 1660 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-206ENST00000443528 NOS1P29475 1434 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 PLA2R1Q13018 1463 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 SYNMO15061 1565 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-206ENST00000443528 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 E9PCH4 1651 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 IDI1Q13907 227 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 PTPRTO14522 1441 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 PKD2Q13563 968 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 PIK3C2BO00750 1634 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 TRIM52Q96A61 297 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-206ENST00000443528 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-206ENST00000443528 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-206ENST00000443528 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-206ENST00000443528 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-206ENST00000443528 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 SLIT1O75093 1534 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 ADGRB3O60242 1522 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 LTKP29376 864 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 MED14O60244 1454 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-206ENST00000443528 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 EID1Q9Y6B2 187 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 FOXD1Q16676 465 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 TRPM2O94759 1503 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 IQGAP1P46940 1657 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-206ENST00000443528 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-206ENST00000443528 ZFYVE9O95405 1425 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-206ENST00000443528 CLTCL1P53675 1640 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-206ENST00000443528 CERKQ8TCT0 537 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-206ENST00000443528 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.37■■□□□ 1.33
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