RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440239.5

CHTF18-204, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHTF18, Length 1,801 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-204ENST00000440239 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.67■■■■□ 3.14
CHTF18-204ENST00000440239 NAIPQ13075 1403 aa34.65■■■■□ 3.14
CHTF18-204ENST00000440239 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-204ENST00000440239 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-204ENST00000440239 HFM1A2PYH4 1435 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-204ENST00000440239 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.6■■■■□ 3.13
CHTF18-204ENST00000440239 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CHTF18-204ENST00000440239 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.57■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.55■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 DEPDC5O75140 1603 aa34.55■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 PTPRMP28827 1452 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 KANK1Q14678 1352 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-204ENST00000440239 CEP152O94986 1710 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC3O15438 1527 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 UNC13BO14795 1591 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 ZMYM3Q14202 1370 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 TRIM52Q96A61 297 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 NUP155O75694 1391 aa34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-204ENST00000440239 MROH2AA6NES4 1674 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 C3P01024 1663 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-204ENST00000440239 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-204ENST00000440239 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-204ENST00000440239 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-204ENST00000440239 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-204ENST00000440239 PZPP20742 1482 aa34.3■■■■□ 3.08
CHTF18-204ENST00000440239 TET3O43151 1660 aa34.28■■■■□ 3.08
CHTF18-204ENST00000440239 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.28■■■■□ 3.08
CHTF18-204ENST00000440239 NPATQ14207 1427 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-204ENST00000440239 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-204ENST00000440239 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.22■■■■□ 3.07
CHTF18-204ENST00000440239 E9PCH4 1651 aa34.19■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.18■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 ERVK-7P63135 1459 aa34.17■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 TNRQ92752 1358 aa34.17■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 PKD2Q13563 968 aa34.16■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 HRCP23327 699 aa34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-204ENST00000440239 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CHTF18-204ENST00000440239 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.13■■■■□ 3.05
CHTF18-204ENST00000440239 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.1■■■■□ 3.05
CHTF18-204ENST00000440239 FOXD1Q16676 465 aa34.1■■■■□ 3.05
CHTF18-204ENST00000440239 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.09■■■■□ 3.05
CHTF18-204ENST00000440239 NOS1P29475 1434 aa34.04■■■■□ 3.04
CHTF18-204ENST00000440239 SYNMO15061 1565 aa34.04■■■■□ 3.04
CHTF18-204ENST00000440239 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.01■■■■□ 3.04
CHTF18-204ENST00000440239 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.01■■■■□ 3.04
CHTF18-204ENST00000440239 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 NLRP1Q9C000 1473 aa33.99■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 HSPA2P54652 639 aa33.98■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.97■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 IDI1Q13907 227 aa33.97■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.96■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 PTPRTO14522 1441 aa33.93■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 PIK3C2BO00750 1634 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 TRPM2O94759 1503 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 PLA2R1Q13018 1463 aa33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-204ENST00000440239 CLTCL1P53675 1640 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-204ENST00000440239 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-204ENST00000440239 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CHTF18-204ENST00000440239 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.81■■■■□ 3
CHTF18-204ENST00000440239 ADGRB3O60242 1522 aa33.81■■■■□ 3
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CHTF18-204ENST00000440239 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
CHTF18-204ENST00000440239 KIF1BO60333 1816 aa33.76■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.76■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.75■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.71■■■□□ 2.99
CHTF18-204ENST00000440239 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.68■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.67■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 RGL3Q3MIN7 710 aa33.65■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 EID1Q9Y6B2 187 aa33.65■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 STRCQ7RTU9 1775 aa33.65■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.65■■■□□ 2.98
CHTF18-204ENST00000440239 SLIT1O75093 1534 aa33.63■■■□□ 2.97
CHTF18-204ENST00000440239 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CHTF18-204ENST00000440239 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CHTF18-204ENST00000440239 LTKP29376 864 aa33.62■■■□□ 2.97
CHTF18-204ENST00000440239 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.62■■■□□ 2.97
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