RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439208.1

RNF144A-AS1-205, RNF144A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNF144A-AS1, Length 757 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 UNC13BO14795 1591 aa27.28■■□□□ 1.96
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.23■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.23■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.22■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TRIM52Q96A61 297 aa27.21■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NUP155O75694 1391 aa27.21■■□□□ 1.95
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 GGT6Q6P531 493 aa27.2■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.2■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KANK1Q14678 1352 aa27.18■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.17■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.16■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PZPP20742 1482 aa27.14■■□□□ 1.94
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.12■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.12■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MLECQ14165 292 aa27.1■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.1■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ABCC3O15438 1527 aa27.09■■□□□ 1.93
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TET3O43151 1660 aa27.06■■□□□ 1.92
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CEP152O94986 1710 aa27.05■■□□□ 1.92
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.03■■□□□ 1.92
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.02■■□□□ 1.92
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.01■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PKD2Q13563 968 aa27.01■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.98■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MROH2AA6NES4 1674 aa26.98■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 E9PCH4 1651 aa26.98■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZMYM3Q14202 1370 aa26.95■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NPATQ14207 1427 aa26.94■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MADDQ8WXG6 1647 aa26.93■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.91■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 FOXD1Q16676 465 aa26.91■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PTPRTO14522 1441 aa26.9■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.89■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PLA2R1Q13018 1463 aa26.86■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NOS1P29475 1434 aa26.85■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 C3P01024 1663 aa26.85■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.84■■□□□ 1.89
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.82■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ERVK-7P63135 1459 aa26.81■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.81■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TRPM2O94759 1503 aa26.8■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.8■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PTPRMP28827 1452 aa26.77■■□□□ 1.88
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SYNMO15061 1565 aa26.75■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.75■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.73■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PIK3C2BO00750 1634 aa26.72■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TNRQ92752 1358 aa26.71■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.71■■□□□ 1.87
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CLTCL1P53675 1640 aa26.69■■□□□ 1.86
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 IDI1Q13907 227 aa26.68■■□□□ 1.86
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.66■■□□□ 1.86
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NLRP1Q9C000 1473 aa26.65■■□□□ 1.86
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KIF1BO60333 1816 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NEUROD1Q13562 356 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.57■■□□□ 1.84
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ADGRB3O60242 1522 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TONSLQ96HA7 1378 aa26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.51■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.5■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RGL3Q3MIN7 710 aa26.49■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.49■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.48■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 STAC3Q96MF2 364 aa26.48■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.42■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 IFT172Q9UG01 1749 aa26.42■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PPLO60437 1756 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms