RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.69■□□□□ 0.9
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RFX8-201ENST00000428343 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.68■□□□□ 0.9
RFX8-201ENST00000428343 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RFX8-201ENST00000428343 NUP155O75694 1391 aa20.65■□□□□ 0.9
RFX8-201ENST00000428343 KANK1Q14678 1352 aa20.65■□□□□ 0.9
RFX8-201ENST00000428343 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.64■□□□□ 0.9
RFX8-201ENST00000428343 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.63■□□□□ 0.89
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RFX8-201ENST00000428343 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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RFX8-201ENST00000428343 HRCP23327 699 aa20.54■□□□□ 0.88
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RFX8-201ENST00000428343 SYNMO15061 1565 aa20.29■□□□□ 0.84
RFX8-201ENST00000428343 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.27■□□□□ 0.84
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RFX8-201ENST00000428343 NEUROD1Q13562 356 aa20.25■□□□□ 0.83
RFX8-201ENST00000428343 TRPM2O94759 1503 aa20.24■□□□□ 0.83
RFX8-201ENST00000428343 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.24■□□□□ 0.83
RFX8-201ENST00000428343 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.23■□□□□ 0.83
RFX8-201ENST00000428343 NLRP1Q9C000 1473 aa20.23■□□□□ 0.83
RFX8-201ENST00000428343 HSPA2P54652 639 aa20.22■□□□□ 0.83
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RFX8-201ENST00000428343 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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RFX8-201ENST00000428343 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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RFX8-201ENST00000428343 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.1■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.09■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 KIF1BO60333 1816 aa20.09■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.09■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 EID1Q9Y6B2 187 aa20.09■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.08■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.08■□□□□ 0.81
RFX8-201ENST00000428343 BCANQ96GW7 911 aa20.08■□□□□ 0.81
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