RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 UNC13BO14795 1591 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
HOXA4-202ENST00000428284 GGT6Q6P531 493 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXA4-202ENST00000428284 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 MLECQ14165 292 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM52Q96A61 297 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 HRCP23327 699 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 CEP152O94986 1710 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 NUP155O75694 1391 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 KANK1Q14678 1352 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXA4-202ENST00000428284 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC3O15438 1527 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 TET3O43151 1660 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 PZPP20742 1482 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 MADDQ8WXG6 1647 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 MROH2AA6NES4 1674 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 E9PCH4 1651 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXA4-202ENST00000428284 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXA4-202ENST00000428284 PKD2Q13563 968 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXA4-202ENST00000428284 C3P01024 1663 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXA4-202ENST00000428284 NPATQ14207 1427 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYM3Q14202 1370 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD1Q16676 465 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRMP28827 1452 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXA4-202ENST00000428284 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXA4-202ENST00000428284 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXA4-202ENST00000428284 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 ERVK-7P63135 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM2O94759 1503 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRTO14522 1441 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 NOS1P29475 1434 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 SYNMO15061 1565 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2R1Q13018 1463 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXA4-202ENST00000428284 CLTCL1P53675 1640 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXA4-202ENST00000428284 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXA4-202ENST00000428284 TNRQ92752 1358 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3C2BO00750 1634 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXA4-202ENST00000428284 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
HOXA4-202ENST00000428284 KIF1BO60333 1816 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXA4-202ENST00000428284 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXA4-202ENST00000428284 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXA4-202ENST00000428284 SIN3AQ96ST3 1273 aa30■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP1Q9C000 1473 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 NEUROD1Q13562 356 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 IDI1Q13907 227 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRB3O60242 1522 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXA4-202ENST00000428284 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.89■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 RGL3Q3MIN7 710 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXA4-202ENST00000428284 TONSLQ96HA7 1378 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXA4-202ENST00000428284 IFT172Q9UG01 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXA4-202ENST00000428284 PPLO60437 1756 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA2P54652 639 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXA4-202ENST00000428284 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXA4-202ENST00000428284 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXA4-202ENST00000428284 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.7■■■□□ 2.35
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