RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ADGRL2O95490 1459 aa27.59■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 PTPRKQ15262 1439 aa27.58■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 ERBINQ96RT1 1412 aa27.58■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 MROH2AA6NES4 1674 aa27.57■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 ITGAEP38570 1179 aa27.55■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.52■■■□□ 2
HERC3-205ENST00000426683 NPATQ14207 1427 aa27.48■■□□□ 1.99
HERC3-205ENST00000426683 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.48■■□□□ 1.99
HERC3-205ENST00000426683 ROCK1Q13464 1354 aa27.48■■□□□ 1.99
HERC3-205ENST00000426683 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.46■■□□□ 1.99
HERC3-205ENST00000426683 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.46■■□□□ 1.99
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.45■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 HSPA2P54652 639 aa27.45■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 ABCC3O15438 1527 aa27.45■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 PZPP20742 1482 aa27.41■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 DEPDC5O75140 1603 aa27.4■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 KANK1Q14678 1352 aa27.39■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
HERC3-205ENST00000426683 CEP152O94986 1710 aa27.36■■□□□ 1.97
HERC3-205ENST00000426683 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.33■■□□□ 1.97
HERC3-205ENST00000426683 TNRQ92752 1358 aa27.33■■□□□ 1.97
HERC3-205ENST00000426683 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.31■■□□□ 1.96
HERC3-205ENST00000426683 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.31■■□□□ 1.96
HERC3-205ENST00000426683 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.29■■□□□ 1.96
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.28■■□□□ 1.96
HERC3-205ENST00000426683 ERVK-7P63135 1459 aa27.26■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 UNC13BO14795 1591 aa27.25■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.25■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.23■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 NAIPQ13075 1403 aa27.23■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 NLRP1Q9C000 1473 aa27.2■■□□□ 1.95
HERC3-205ENST00000426683 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.2■■□□□ 1.94
HERC3-205ENST00000426683 NUP155O75694 1391 aa27.19■■□□□ 1.94
HERC3-205ENST00000426683 HFM1A2PYH4 1435 aa27.18■■□□□ 1.94
HERC3-205ENST00000426683 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.16■■□□□ 1.94
HERC3-205ENST00000426683 TET3O43151 1660 aa27.14■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.13■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 STRCQ7RTU9 1775 aa27.13■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.12■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 PLA2R1Q13018 1463 aa27.12■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.11■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 NOS1P29475 1434 aa27.1■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.1■■□□□ 1.93
HERC3-205ENST00000426683 PKD2Q13563 968 aa27.07■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 SYNMO15061 1565 aa27.05■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 PTPRTO14522 1441 aa27.05■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 IDI1Q13907 227 aa27.04■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 TRIM52Q96A61 297 aa27.04■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 E9PCH4 1651 aa27.03■■□□□ 1.92
HERC3-205ENST00000426683 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.01■■□□□ 1.91
HERC3-205ENST00000426683 ANKLE2Q86XL3 938 aa27■■□□□ 1.91
HERC3-205ENST00000426683 STAG3Q9UJ98 1225 aa27■■□□□ 1.91
HERC3-205ENST00000426683 PIK3C2BO00750 1634 aa27■■□□□ 1.91
HERC3-205ENST00000426683 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-205ENST00000426683 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.95■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.92■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 ADGRB3O60242 1522 aa26.91■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.91■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 SLIT1O75093 1534 aa26.9■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.9■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HERC3-205ENST00000426683 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.88■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 MED14O60244 1454 aa26.87■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 LTKP29376 864 aa26.87■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 EID1Q9Y6B2 187 aa26.87■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.86■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.85■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.83■■□□□ 1.89
HERC3-205ENST00000426683 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.83■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 CERKQ8TCT0 537 aa26.8■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 TRPM2O94759 1503 aa26.8■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 IQGAP1P46940 1657 aa26.79■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 FOXD1Q16676 465 aa26.79■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.78■■□□□ 1.88
HERC3-205ENST00000426683 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.76■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 ZFYVE9O95405 1425 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 CLTCL1P53675 1640 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms