RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423832.5

NICN1-203, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NICN1, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-203ENST00000423832 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.8■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 ERBINQ96RT1 1412 aa22.8■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 C3P01024 1663 aa22.79■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.79■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 ZMYM3Q14202 1370 aa22.78■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.77■■□□□ 1.24
NICN1-203ENST00000423832 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.75■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 MROH2AA6NES4 1674 aa22.75■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.74■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 ROCK1Q13464 1354 aa22.74■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.73■■□□□ 1.23
NICN1-203ENST00000423832 CEP152O94986 1710 aa22.69■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 ABCC3O15438 1527 aa22.68■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 DEPDC5O75140 1603 aa22.67■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 KANK1Q14678 1352 aa22.66■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.66■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.66■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 HSPA2P54652 639 aa22.64■■□□□ 1.22
NICN1-203ENST00000423832 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.64■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 NPATQ14207 1427 aa22.62■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.62■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.62■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 PZPP20742 1482 aa22.61■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 NAIPQ13075 1403 aa22.6■■□□□ 1.21
NICN1-203ENST00000423832 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.57■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.56■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 HFM1A2PYH4 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 UNC13BO14795 1591 aa22.56■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 TNRQ92752 1358 aa22.55■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 NUP155O75694 1391 aa22.55■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.54■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.53■■□□□ 1.2
NICN1-203ENST00000423832 ERVK-7P63135 1459 aa22.52■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.51■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.5■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 TRIM52Q96A61 297 aa22.49■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.49■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.48■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 TET3O43151 1660 aa22.47■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
NICN1-203ENST00000423832 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.44■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 E9PCH4 1651 aa22.43■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 NLRP1Q9C000 1473 aa22.42■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.4■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.4■■□□□ 1.18
NICN1-203ENST00000423832 SYNMO15061 1565 aa22.39■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 STRCQ7RTU9 1775 aa22.38■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 NOS1P29475 1434 aa22.38■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 IDI1Q13907 227 aa22.37■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.37■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.36■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.36■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 PIK3C2BO00750 1634 aa22.34■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 PKD2Q13563 968 aa22.34■■□□□ 1.17
NICN1-203ENST00000423832 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.32■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 FOXD1Q16676 465 aa22.31■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.31■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 PLA2R1Q13018 1463 aa22.3■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-203ENST00000423832 ADGRB3O60242 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 PTPRTO14522 1441 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.23■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 LTKP29376 864 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NICN1-203ENST00000423832 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.2■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 EID1Q9Y6B2 187 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 SLIT1O75093 1534 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 TRPM2O94759 1503 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 CLTCL1P53675 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 HRCP23327 699 aa22.14■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NICN1-203ENST00000423832 IQGAP1P46940 1657 aa22.13■■□□□ 1.13
NICN1-203ENST00000423832 MED14O60244 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
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