RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423170.1

RNF25-202, Transcript of ring finger protein 25, humanhuman

TSL 5

Gene RNF25, Length 624 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25-202ENST00000423170 DEPDC5O75140 1603 aa20.64■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 MBD5Q9P267 1494 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 GGT6Q6P531 493 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 PZPP20742 1482 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 IQGAP1P46940 1657 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 MED14O60244 1454 aa20.58■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 PIP4K2BP78356 416 aa20.58■□□□□ 0.89
RNF25-202ENST00000423170 SYNMO15061 1565 aa20.58■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 TNRQ92752 1358 aa20.58■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.57■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.56■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 TOM1O60784 492 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 NLRP1Q9C000 1473 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
RNF25-202ENST00000423170 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 MIA2Q96PC5 1412 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF25-202ENST00000423170 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 CEP162Q5TB80 1403 aa20.44■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 CEP152O94986 1710 aa20.44■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 ABCC3O15438 1527 aa20.43■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.43■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.43■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 KIF3BO15066 747 aa20.42■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNF25-202ENST00000423170 ERVK-7P63135 1459 aa20.39■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.38■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 NCOA2Q15596 1464 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 FOXD1Q16676 465 aa20.34■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.33■□□□□ 0.85
RNF25-202ENST00000423170 SLIT1O75093 1534 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF25-202ENST00000423170 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RNF25-202ENST00000423170 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.28■□□□□ 0.84
RNF25-202ENST00000423170 PIK3C2BO00750 1634 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF25-202ENST00000423170 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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RNF25-202ENST00000423170 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.23■□□□□ 0.83
RNF25-202ENST00000423170 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.22■□□□□ 0.83
RNF25-202ENST00000423170 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.22■□□□□ 0.83
RNF25-202ENST00000423170 LTKP29376 864 aa20.21■□□□□ 0.83
RNF25-202ENST00000423170 POTEAQ6S8J7 498 aa20.2■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 NWD1Q149M9 1564 aa20.2■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 TET3O43151 1660 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 PHLPP1O60346 1717 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF25-202ENST00000423170 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 TSPY4P0CV99 314 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 TSPY10P0CW01 314 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 TMEM94Q12767 1356 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF25-202ENST00000423170 ERBINQ96RT1 1412 aa20.08■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 ADGRB3O60242 1522 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 LRP6O75581 1613 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 KIF15Q9NS87 1388 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 KCNA6P17658 529 aa20.02■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 EID1Q9Y6B2 187 aa20.02■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 SHPRHQ149N8 1683 aa20.02■□□□□ 0.8
RNF25-202ENST00000423170 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.01■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 ABCC5O15440 1437 aa20■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 NOS1P29475 1434 aa19.99■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 JCADQ9P266 1359 aa19.97■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.97■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RNF25-202ENST00000423170 ZFYVE9O95405 1425 aa19.95■□□□□ 0.78
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