RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412476.5

PHYHD1-204, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene PHYHD1, Length 1,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-204ENST00000412476 NUP155O75694 1391 aa24.39■■□□□ 1.5
PHYHD1-204ENST00000412476 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.39■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 DEPDC5O75140 1603 aa24.39■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 PZPP20742 1482 aa24.38■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 REREQ9P2R6 1566 aa24.38■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.37■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.34■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.33■■□□□ 1.49
PHYHD1-204ENST00000412476 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.32■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.32■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 AGLP35573 1532 aa24.3■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.3■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.29■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 KANK1Q14678 1352 aa24.27■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 GGT6Q6P531 493 aa24.27■■□□□ 1.48
PHYHD1-204ENST00000412476 PKD2Q13563 968 aa24.25■■□□□ 1.47
PHYHD1-204ENST00000412476 FOXD1Q16676 465 aa24.24■■□□□ 1.47
PHYHD1-204ENST00000412476 CEP152O94986 1710 aa24.22■■□□□ 1.47
PHYHD1-204ENST00000412476 TET3O43151 1660 aa24.21■■□□□ 1.47
PHYHD1-204ENST00000412476 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 ABCC3O15438 1527 aa24.17■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 E9PCH4 1651 aa24.17■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.16■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.16■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.15■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PHYHD1-204ENST00000412476 MLECQ14165 292 aa24.14■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.14■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.13■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.12■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 NEUROD1Q13562 356 aa24.1■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PHYHD1-204ENST00000412476 PLA2R1Q13018 1463 aa24.07■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.06■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 NPATQ14207 1427 aa24.05■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.03■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 PTPRTO14522 1441 aa24.03■■□□□ 1.44
PHYHD1-204ENST00000412476 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 TRPM2O94759 1503 aa24■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.98■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.98■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.97■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 MROH2AA6NES4 1674 aa23.96■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.96■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.96■■□□□ 1.43
PHYHD1-204ENST00000412476 CLTCL1P53675 1640 aa23.94■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 ZMYM3Q14202 1370 aa23.94■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 TONSLQ96HA7 1378 aa23.94■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 NOS1P29475 1434 aa23.94■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 SYNMO15061 1565 aa23.91■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.91■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.91■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 ERVK-7P63135 1459 aa23.9■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 MADDQ8WXG6 1647 aa23.89■■□□□ 1.42
PHYHD1-204ENST00000412476 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.87■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 KIF1BO60333 1816 aa23.87■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 C3P01024 1663 aa23.87■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.87■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 PIK3C2BO00750 1634 aa23.86■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.83■■□□□ 1.41
PHYHD1-204ENST00000412476 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.81■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 RGL3Q3MIN7 710 aa23.8■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.8■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 IDI1Q13907 227 aa23.8■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 ADGRB3O60242 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
PHYHD1-204ENST00000412476 TNRQ92752 1358 aa23.76■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.75■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.74■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.74■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.72■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.71■■□□□ 1.39
PHYHD1-204ENST00000412476 IFT172Q9UG01 1749 aa23.69■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.68■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 PTPRMP28827 1452 aa23.67■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.67■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 PPLO60437 1756 aa23.66■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 NLRP1Q9C000 1473 aa23.66■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.66■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.64■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.64■■□□□ 1.38
PHYHD1-204ENST00000412476 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PHYHD1-204ENST00000412476 STAC3Q96MF2 364 aa23.63■■□□□ 1.37
PHYHD1-204ENST00000412476 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.63■■□□□ 1.37
PHYHD1-204ENST00000412476 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.63■■□□□ 1.37
PHYHD1-204ENST00000412476 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.62■■□□□ 1.37
PHYHD1-204ENST00000412476 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms