RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERBINQ96RT1 1412 aa13.22□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3P01024 1663 aa13.21□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.21□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRL2O95490 1459 aa13.21□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPATQ14207 1427 aa13.21□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.2□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF15Q9NS87 1388 aa13.19□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.17□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEPDC5O75140 1603 aa13.16□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCOA1Q15788 1441 aa13.15□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.15□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF3BO15066 747 aa13.15□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGT6Q6P531 493 aa13.15□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZMYM3Q14202 1370 aa13.15□□□□□ -0.3
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ROCK1Q13464 1354 aa13.14□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PZPP20742 1482 aa13.13□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.13□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCC3O15438 1527 aa13.12□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRKQ15262 1439 aa13.11□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.11□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KANK1Q14678 1352 aa13.1□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.1□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.09□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.09□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.09□□□□□ -0.31
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.08□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.08□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEP152O94986 1710 aa13.08□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.07□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP1Q9C000 1473 aa13.07□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UNC13BO14795 1591 aa13.06□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.06□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.05□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.04□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLA2R1Q13018 1463 aa13.04□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNRQ92752 1358 aa13.04□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.03□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-7P63135 1459 aa13.03□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.03□□□□□ -0.32
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.02□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TET3O43151 1660 aa13.02□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STRCQ7RTU9 1775 aa12.99□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRTO14522 1441 aa12.99□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HFM1A2PYH4 1435 aa12.98□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.98□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA2P54652 639 aa12.97□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKD2Q13563 968 aa12.97□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POTEDQ86YR6 584 aa12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOS1P29475 1434 aa12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAIPQ13075 1403 aa12.95□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.93□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGAEP38570 1179 aa12.93□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYNMO15061 1565 aa12.91□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.91□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E9PCH4 1651 aa12.91□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP155O75694 1391 aa12.91□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRB3O60242 1522 aa12.9□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLIT1O75093 1534 aa12.9□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIK3C2BO00750 1634 aa12.9□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED14O60244 1454 aa12.9□□□□□ -0.34
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.89□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.88□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.88□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.88□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.87□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQGAP1P46940 1657 aa12.86□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.84□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.84□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPM2O94759 1503 aa12.83□□□□□ -0.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EID1Q9Y6B2 187 aa12.83□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.83□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.82□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IDI1Q13907 227 aa12.82□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.81□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPS1P31327 1500 aa12.81□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.8□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF1BO60333 1816 aa12.78□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.78□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.78□□□□□ -0.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CERKQ8TCT0 537 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms