RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.04□□□□□ -0.32
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.04□□□□□ -0.32
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PIP4K2BP78356 416 aa13.04□□□□□ -0.32
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNRQ92752 1358 aa13.04□□□□□ -0.32
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.03□□□□□ -0.32
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOM1O60784 492 aa12.98□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.97□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.97□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MIA2Q96PC5 1412 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.96□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.94□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IQGAP1P46940 1657 aa12.94□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NCOA2Q15596 1464 aa12.94□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCC3O15438 1527 aa12.93□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LTKP29376 864 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.85□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CEP152O94986 1710 aa12.84□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TSPY10P0CW01 314 aa12.82□□□□□ -0.36
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.75□□□□□ -0.37
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.75□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.74□□□□□ -0.37
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CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCC5O15440 1437 aa12.73□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TET3O43151 1660 aa12.73□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.73□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERBINQ96RT1 1412 aa12.72□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.72□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.71□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.71□□□□□ -0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NWD1Q149M9 1564 aa12.7□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IDI1Q13907 227 aa12.7□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.7□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EID1Q9Y6B2 187 aa12.7□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.69□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCNA6P17658 529 aa12.69□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NOS1P29475 1434 aa12.67□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DAPK1P53355 1430 aa12.67□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ADGRB3O60242 1522 aa12.67□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.66□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.65□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.65□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LRP6O75581 1613 aa12.65□□□□□ -0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZFYVE9O95405 1425 aa12.63□□□□□ -0.39
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PHLPP1O60346 1717 aa12.63□□□□□ -0.39
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MSH6P52701 1360 aa12.62□□□□□ -0.39
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