RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CPS1P31327 1500 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 MBD5Q9P267 1494 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 TNRQ92752 1358 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXD12-201ENST00000404162 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 TIAM1Q13009 1591 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 KIF3BO15066 747 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 PZPP20742 1482 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXD12-201ENST00000404162 ALKQ9UM73 1620 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXD12-201ENST00000404162 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD12-201ENST00000404162 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXD12-201ENST00000404162 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXD12-201ENST00000404162 MIA2Q96PC5 1412 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXD12-201ENST00000404162 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 MED14O60244 1454 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP1Q9C000 1473 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 DEPDC5O75140 1603 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 CEP162Q5TB80 1403 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD12-201ENST00000404162 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXD12-201ENST00000404162 IQGAP1P46940 1657 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD12-201ENST00000404162 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA2Q15596 1464 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD12-201ENST00000404162 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 TSPY4P0CV99 314 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 TSPY10P0CW01 314 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 SYNMO15061 1565 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC3O15438 1527 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-7P63135 1459 aa31■■■□□ 2.55
HOXD12-201ENST00000404162 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HOXD12-201ENST00000404162 LTKP29376 864 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 CEP152O94986 1710 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD12-201ENST00000404162 SLIT1O75093 1534 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD12-201ENST00000404162 POTEAQ6S8J7 498 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD12-201ENST00000404162 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD12-201ENST00000404162 EID1Q9Y6B2 187 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3C2BO00750 1634 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM94Q12767 1356 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.7■■■□□ 2.51
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.68■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 KCNA6P17658 529 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K1Q13233 1512 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 KIF15Q9NS87 1388 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD12-201ENST00000404162 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 IDI1Q13907 227 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 TET3O43151 1660 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 ERBINQ96RT1 1412 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD12-201ENST00000404162 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD12-201ENST00000404162 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC5O15440 1437 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXD12-201ENST00000404162 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD12-201ENST00000404162 KANK1Q14678 1352 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD12-201ENST00000404162 NWD1Q149M9 1564 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 PHLPP1O60346 1717 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 SLAIN2Q9P270 581 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 MSH6P52701 1360 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 JCADQ9P266 1359 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 BCANQ96GW7 911 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 NOS1P29475 1434 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRB3O60242 1522 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXD12-201ENST00000404162 DAPK1P53355 1430 aa30.44■■■□□ 2.46
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