RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP49.67■■■■■ 5.54
CSNK1E-204ENST00000403904 DEPDC5O75140 1603 aa49.64■■■■■ 5.54
CSNK1E-204ENST00000403904 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP49.64■■■■■ 5.541e-6■■■□□ 14.6
CSNK1E-204ENST00000403904 MROH1Q8NDA8 1641 aa49.61■■■■■ 5.53
CSNK1E-204ENST00000403904 UNC13BO14795 1591 aa49.6■■■■■ 5.53
CSNK1E-204ENST00000403904 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP49.56■■■■■ 5.52
CSNK1E-204ENST00000403904 TRIM52Q96A61 297 aa49.54■■■■■ 5.52
CSNK1E-204ENST00000403904 HRCP23327 699 aa49.53■■■■■ 5.52
CSNK1E-204ENST00000403904 NUP155O75694 1391 aa49.51■■■■■ 5.52
CSNK1E-204ENST00000403904 KANK1Q14678 1352 aa49.48■■■■■ 5.51
CSNK1E-204ENST00000403904 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa49.44■■■■■ 5.51
CSNK1E-204ENST00000403904 PPP6R1Q9UPN7 881 aa49.44■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 VWDEQ8N2E2 1590 aa49.43■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 CEP152O94986 1710 aa49.41■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 IQGAP3Q86VI3 1631 aa49.4■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 ADAMTSL3P82987 1691 aa49.39■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM5DQ9BY66 1539 aa49.39■■■■■ 5.5
CSNK1E-204ENST00000403904 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa49.37■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCC3O15438 1527 aa49.37■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP49.37■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa49.36■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 MADDQ8WXG6 1647 aa49.34■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 PZPP20742 1482 aa49.33■■■■■ 5.49
CSNK1E-204ENST00000403904 LMTK2Q8IWU2 1503 aa49.29■■■■■ 5.48
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
CSNK1E-204ENST00000403904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa49.25■■■■■ 5.48
CSNK1E-204ENST00000403904 MPHOSPH9Q99550 1183 aa49.24■■■■■ 5.47
CSNK1E-204ENST00000403904 TET3O43151 1660 aa49.24■■■■■ 5.47
CSNK1E-204ENST00000403904 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa49.24■■■■■ 5.47
CSNK1E-204ENST00000403904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa49.18■■■■■ 5.46
CSNK1E-204ENST00000403904 EFCAB6Q5THR3 1501 aa49.18■■■■■ 5.46
CSNK1E-204ENST00000403904 MROH2AA6NES4 1674 aa49.17■■■■■ 5.46
CSNK1E-204ENST00000403904 ZMYM3Q14202 1370 aa49.17■■■■■ 5.46
CSNK1E-204ENST00000403904 PKD2Q13563 968 aa49.14■■■■■ 5.46
CSNK1E-204ENST00000403904 E9PCH4 1651 aa49.12■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 NPATQ14207 1427 aa49.1■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa49.08■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 C3P01024 1663 aa49.07■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP49.07■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 FOXD1Q16676 465 aa49.07■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 PLPPR3Q6T4P5 718 aa49.07■■■■■ 5.45
CSNK1E-204ENST00000403904 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP49.05■■■■■ 5.44
CSNK1E-204ENST00000403904 PTPRMP28827 1452 aa49.01■■■■■ 5.44
CSNK1E-204ENST00000403904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP49■■■■■ 5.44
CSNK1E-204ENST00000403904 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
CSNK1E-204ENST00000403904 PREX1Q8TCU6 1659 aa48.93■■■■■ 5.42
CSNK1E-204ENST00000403904 ERVK-7P63135 1459 aa48.89■■■■■ 5.42
CSNK1E-204ENST00000403904 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa48.87■■■■■ 5.41
CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa48.85■■■■■ 5.41
CSNK1E-204ENST00000403904 NOS1P29475 1434 aa48.85■■■■■ 5.41
CSNK1E-204ENST00000403904 PTPRTO14522 1441 aa48.83■■■■■ 5.41
CSNK1E-204ENST00000403904 PLA2R1Q13018 1463 aa48.82■■■■■ 5.41
CSNK1E-204ENST00000403904 SYNMO15061 1565 aa48.79■■■■■ 5.4
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa48.77■■■■■ 5.4
CSNK1E-204ENST00000403904 TNRQ92752 1358 aa48.75■■■■■ 5.4
CSNK1E-204ENST00000403904 TRPM2O94759 1503 aa48.74■■■■■ 5.39
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CSNK1E-204ENST00000403904 UGGT1Q9NYU2 1555 aa48.7■■■■■ 5.39
CSNK1E-204ENST00000403904 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP48.66■■■■■ 5.38
CSNK1E-204ENST00000403904 CLTCL1P53675 1640 aa48.63■■■■■ 5.38
CSNK1E-204ENST00000403904 IDI1Q13907 227 aa48.63■■■■■ 5.38
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC52A1Q9NWF4 448 aa48.63■■■■■ 5.38
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC144AA2RUR9 1427 aa48.62■■■■■ 5.37
CSNK1E-204ENST00000403904 PIK3C2BO00750 1634 aa48.62■■■■■ 5.37
CSNK1E-204ENST00000403904 MYO3AQ8NEV4 1616 aa48.58■■■■■ 5.37
CSNK1E-204ENST00000403904 NLRP1Q9C000 1473 aa48.55■■■■■ 5.36
CSNK1E-204ENST00000403904 SIN3AQ96ST3 1273 aa48.55■■■■■ 5.36
CSNK1E-204ENST00000403904 CLSPNQ9HAW4 1339 aa48.48■■■■■ 5.35
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF1BO60333 1816 aa48.47■■■■■ 5.35
CSNK1E-204ENST00000403904 CHGAP10645 457 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
CSNK1E-204ENST00000403904 NEUROD1Q13562 356 aa48.46■■■■■ 5.35
CSNK1E-204ENST00000403904 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa48.46■■■■■ 5.35
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CSNK1E-204ENST00000403904 A2ML1A8K2U0 1454 aa48.43■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 STAG3Q9UJ98 1225 aa48.43■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa48.4■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 MYO5BQ9ULV0 1848 aa48.39■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRB3O60242 1522 aa48.39■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 UBR1Q8IWV7 1749 aa48.38■■■■■ 5.34
CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa48.33■■■■■ 5.33
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
CSNK1E-204ENST00000403904 RGL3Q3MIN7 710 aa48.32■■■■■ 5.33
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
CSNK1E-204ENST00000403904 LMTK3Q96Q04 1460 aa48.25■■■■■ 5.31
CSNK1E-204ENST00000403904 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.31
CSNK1E-204ENST00000403904 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.24■■■■■ 5.31
CSNK1E-204ENST00000403904 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
CSNK1E-204ENST00000403904 TMEM2Q9UHN6 1383 aa48.15■■■■■ 5.3
CSNK1E-204ENST00000403904 HSPA2P54652 639 aa48.13■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 TONSLQ96HA7 1378 aa48.12■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 L3MBTL2Q969R5 705 aa48.1■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 SLIT1O75093 1534 aa48.09■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 RIMS2Q9UQ26 1411 aa48.09■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa48.09■■■■■ 5.29
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