RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402077.7

KCTD17-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD17, Length 1,691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-201ENST00000402077 AGLP35573 1532 aa41.07■■■■■ 4.16
KCTD17-201ENST00000402077 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
KCTD17-201ENST00000402077 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
KCTD17-201ENST00000402077 KIF3BO15066 747 aa40.95■■■■■ 4.15
KCTD17-201ENST00000402077 DEPDC5O75140 1603 aa40.94■■■■■ 4.14
KCTD17-201ENST00000402077 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
KCTD17-201ENST00000402077 UNC13BO14795 1591 aa40.89■■■■■ 4.14
KCTD17-201ENST00000402077 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.88■■■■■ 4.13
KCTD17-201ENST00000402077 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
KCTD17-201ENST00000402077 GGT6Q6P531 493 aa40.82■■■■■ 4.13
KCTD17-201ENST00000402077 MLECQ14165 292 aa40.79■■■■■ 4.12
KCTD17-201ENST00000402077 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.75■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 CEP152O94986 1710 aa40.73■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.73■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.72■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.71■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.7■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 KANK1Q14678 1352 aa40.7■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.7■■■■■ 4.11
KCTD17-201ENST00000402077 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.69■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 NUP155O75694 1391 aa40.68■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 TRIM52Q96A61 297 aa40.67■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.66■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.66■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 MADDQ8WXG6 1647 aa40.65■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 ABCC3O15438 1527 aa40.65■■■■■ 4.1
KCTD17-201ENST00000402077 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.63■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 TET3O43151 1660 aa40.6■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.6■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.59■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 MROH2AA6NES4 1674 aa40.59■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 PZPP20742 1482 aa40.58■■■■■ 4.09
KCTD17-201ENST00000402077 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.56■■■■■ 4.08
KCTD17-201ENST00000402077 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.56■■■■■ 4.08
KCTD17-201ENST00000402077 NEUROD1Q13562 356 aa40.56■■■■■ 4.08
KCTD17-201ENST00000402077 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.54■■■■■ 4.08
KCTD17-201ENST00000402077 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.52■■■■■ 4.08
KCTD17-201ENST00000402077 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
KCTD17-201ENST00000402077 E9PCH4 1651 aa40.48■■■■■ 4.07
KCTD17-201ENST00000402077 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
KCTD17-201ENST00000402077 C3P01024 1663 aa40.46■■■■■ 4.07
KCTD17-201ENST00000402077 ZMYM3Q14202 1370 aa40.42■■■■■ 4.06
KCTD17-201ENST00000402077 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.41■■■■■ 4.06
KCTD17-201ENST00000402077 TONSLQ96HA7 1378 aa40.41■■■■■ 4.06
KCTD17-201ENST00000402077 NPATQ14207 1427 aa40.39■■■■■ 4.06
KCTD17-201ENST00000402077 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
KCTD17-201ENST00000402077 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.36■■■■■ 4.05
KCTD17-201ENST00000402077 PKD2Q13563 968 aa40.36■■■■■ 4.05
KCTD17-201ENST00000402077 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.34■■■■■ 4.05
KCTD17-201ENST00000402077 PTPRMP28827 1452 aa40.34■■■■■ 4.05
KCTD17-201ENST00000402077 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
KCTD17-201ENST00000402077 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.31■■■■■ 4.04
KCTD17-201ENST00000402077 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
KCTD17-201ENST00000402077 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
KCTD17-201ENST00000402077 FOXD1Q16676 465 aa40.25■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.25■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 ERVK-7P63135 1459 aa40.25■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.23■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 NOS1P29475 1434 aa40.2■■■■■ 4.03
KCTD17-201ENST00000402077 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
KCTD17-201ENST00000402077 SYNMO15061 1565 aa40.18■■■■■ 4.02
KCTD17-201ENST00000402077 PTPRTO14522 1441 aa40.18■■■■■ 4.02
KCTD17-201ENST00000402077 TRPM2O94759 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
KCTD17-201ENST00000402077 PLA2R1Q13018 1463 aa40.14■■■■■ 4.02
KCTD17-201ENST00000402077 TNRQ92752 1358 aa40.11■■■■■ 4.01
KCTD17-201ENST00000402077 PIK3C2BO00750 1634 aa40.09■■■■■ 4.01
KCTD17-201ENST00000402077 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.07■■■■■ 4
KCTD17-201ENST00000402077 CLTCL1P53675 1640 aa40.06■■■■■ 4
KCTD17-201ENST00000402077 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.06■■■■■ 4
KCTD17-201ENST00000402077 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.01■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 KIF1BO60333 1816 aa40■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 NLRP1Q9C000 1473 aa39.99■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.99■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.96■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
KCTD17-201ENST00000402077 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.93■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 IDI1Q13907 227 aa39.93■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.89■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.88■■■■□ 3.98
KCTD17-201ENST00000402077 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.87■■■■□ 3.97
KCTD17-201ENST00000402077 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.87■■■■□ 3.97
KCTD17-201ENST00000402077 ADGRB3O60242 1522 aa39.86■■■■□ 3.97
KCTD17-201ENST00000402077 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.79■■■■□ 3.96
KCTD17-201ENST00000402077 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
KCTD17-201ENST00000402077 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.78■■■■□ 3.96
KCTD17-201ENST00000402077 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.76■■■■□ 3.96
KCTD17-201ENST00000402077 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.74■■■■□ 3.95
KCTD17-201ENST00000402077 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.68■■■■□ 3.94
KCTD17-201ENST00000402077 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
KCTD17-201ENST00000402077 IFT172Q9UG01 1749 aa39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms