RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.5■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.5■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 DEPDC5O75140 1603 aa45.46■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 NAIPQ13075 1403 aa45.44■■■■■ 4.87
PKDCC-202ENST00000401498 CNTLNQ9NXG0 1405 aa45.44■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 GCC2Q8IWJ2 1684 aa45.41■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 HFM1A2PYH4 1435 aa45.4■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.39■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 MROH2AA6NES4 1674 aa45.38■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.38■■■■■ 4.86
PKDCC-202ENST00000401498 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa45.38■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.853e-7■■□□□ 12.4
PKDCC-202ENST00000401498 C3P01024 1663 aa45.34■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYM3Q14202 1370 aa45.33■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 PLPPR3Q6T4P5 718 aa45.33■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC3O15438 1527 aa45.32■■■■■ 4.85
PKDCC-202ENST00000401498 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
PKDCC-202ENST00000401498 CEP152O94986 1710 aa45.29■■■■■ 4.84
PKDCC-202ENST00000401498 UNC13BO14795 1591 aa45.28■■■■■ 4.84
PKDCC-202ENST00000401498 VWDEQ8N2E2 1590 aa45.28■■■■■ 4.84
PKDCC-202ENST00000401498 KANK1Q14678 1352 aa45.25■■■■■ 4.83
PKDCC-202ENST00000401498 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.18■■■■■ 4.82
PKDCC-202ENST00000401498 LMTK2Q8IWU2 1503 aa45.16■■■■■ 4.82
PKDCC-202ENST00000401498 NUP155O75694 1391 aa45.12■■■■■ 4.81
PKDCC-202ENST00000401498 PZPP20742 1482 aa45.12■■■■■ 4.81
PKDCC-202ENST00000401498 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.11■■■■■ 4.81
PKDCC-202ENST00000401498 IQGAP3Q86VI3 1631 aa45.1■■■■■ 4.81
PKDCC-202ENST00000401498 NPATQ14207 1427 aa45.07■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa45.05■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 TET3O43151 1660 aa45.03■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 EFCAB6Q5THR3 1501 aa45.03■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
PKDCC-202ENST00000401498 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa44.98■■■■■ 4.79
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM52Q96A61 297 aa44.98■■■■■ 4.79
PKDCC-202ENST00000401498 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.95■■■■■ 4.79
PKDCC-202ENST00000401498 ERVK-7P63135 1459 aa44.93■■■■■ 4.78
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.93■■■■■ 4.78
PKDCC-202ENST00000401498 E9PCH4 1651 aa44.91■■■■■ 4.78
PKDCC-202ENST00000401498 TNRQ92752 1358 aa44.9■■■■■ 4.78
PKDCC-202ENST00000401498 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
PKDCC-202ENST00000401498 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.88■■■■■ 4.77
PKDCC-202ENST00000401498 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.86■■■■■ 4.77
PKDCC-202ENST00000401498 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.86■■■■■ 4.77
PKDCC-202ENST00000401498 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
PKDCC-202ENST00000401498 HRCP23327 699 aa44.8■■■■■ 4.76
PKDCC-202ENST00000401498 NOS1P29475 1434 aa44.8■■■■■ 4.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
PKDCC-202ENST00000401498 SYNMO15061 1565 aa44.75■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 NLRP1Q9C000 1473 aa44.72■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 PKD2Q13563 968 aa44.72■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 MPHOSPH9Q99550 1183 aa44.71■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.69■■■■■ 4.75
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA2P54652 639 aa44.68■■■■■ 4.74
PKDCC-202ENST00000401498 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.63■■■■■ 4.74
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRTO14522 1441 aa44.62■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 IDI1Q13907 227 aa44.6■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 SLC52A1Q9NWF4 448 aa44.59■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 FOXD1Q16676 465 aa44.58■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 PIK3C2BO00750 1634 aa44.58■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.57■■■■■ 4.73
PKDCC-202ENST00000401498 PLA2R1Q13018 1463 aa44.54■■■■■ 4.72
PKDCC-202ENST00000401498 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.53■■■■■ 4.72
PKDCC-202ENST00000401498 TRPM2O94759 1503 aa44.51■■■■■ 4.72
PKDCC-202ENST00000401498 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.48■■■■■ 4.71
PKDCC-202ENST00000401498 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
PKDCC-202ENST00000401498 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRB3O60242 1522 aa44.42■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 CLTCL1P53675 1640 aa44.42■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 STRCQ7RTU9 1775 aa44.41■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 STAG3Q9UJ98 1225 aa44.41■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa44.39■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.39■■■■■ 4.7
PKDCC-202ENST00000401498 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
PKDCC-202ENST00000401498 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.3■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 SLIT1O75093 1534 aa44.3■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.29■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM2Q9UHN6 1383 aa44.28■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 KIF1BO60333 1816 aa44.28■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa44.27■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC144AA2RUR9 1427 aa44.26■■■■■ 4.68
PKDCC-202ENST00000401498 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
PKDCC-202ENST00000401498 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.24■■■■■ 4.67
PKDCC-202ENST00000401498 LTKP29376 864 aa44.2■■■■■ 4.67
PKDCC-202ENST00000401498 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.19■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.17■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 ZFYVE9O95405 1425 aa44.15■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 EID1Q9Y6B2 187 aa44.14■■■■■ 4.66
PKDCC-202ENST00000401498 RIMS2Q9UQ26 1411 aa44.13■■■■■ 4.66
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