RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRKQ15262 1439 aa23.25■■□□□ 1.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MADDQ8WXG6 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.21■■□□□ 1.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGAEP38570 1179 aa23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYM3Q14202 1370 aa23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KANK1Q14678 1352 aa23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPATQ14207 1427 aa23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HFM1A2PYH4 1435 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH2AA6NES4 1674 aa23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC3O15438 1527 aa23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAIPQ13075 1403 aa23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PZPP20742 1482 aa23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEPDC5O75140 1603 aa23■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNA4P22459 653 aa23■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.98■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C3P01024 1663 aa22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP155O75694 1391 aa22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNRQ92752 1358 aa22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC13BO14795 1591 aa22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK-7P63135 1459 aa22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP1Q9C000 1473 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM52Q96A61 297 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOS1P29475 1434 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HRCP23327 699 aa22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPA2P54652 639 aa22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP152O94986 1710 aa22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TET3O43151 1660 aa22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2R1Q13018 1463 aa22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDI1Q13907 227 aa22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKD2Q13563 968 aa22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRTO14522 1441 aa22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNMO15061 1565 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 E9PCH4 1651 aa22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRB3O60242 1522 aa22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPM2O94759 1503 aa22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLIT1O75093 1534 aa22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EID1Q9Y6B2 187 aa22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIK3C2BO00750 1634 aa22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED14O60244 1454 aa22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTKP29376 864 aa22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFYVE9O95405 1425 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRCQ7RTU9 1775 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.48■■□□□ 1.19
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