RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.95■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.95■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.95■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 TIAM1Q13009 1591 aa21.95■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 CPS1P31327 1500 aa21.94■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 TOM1O60784 492 aa21.93■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF3BO15066 747 aa21.92■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 PZPP20742 1482 aa21.91■■□□□ 1.1
CHCHD2-201ENST00000395422 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.13e-17■■■■■ 27.8
CHCHD2-201ENST00000395422 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.89■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 ALKQ9UM73 1620 aa21.88■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.88■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.87■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 CEP162Q5TB80 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 MIA2Q96PC5 1412 aa21.86■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.85■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.85■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.84■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CHCHD2-201ENST00000395422 MED14O60244 1454 aa21.83■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.82■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NLRP1Q9C000 1473 aa21.82■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.81■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.8■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 DEPDC5O75140 1603 aa21.77■■□□□ 1.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NCOA2Q15596 1464 aa21.77■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.75■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.75■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 IQGAP1P46940 1657 aa21.72■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.71■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCC3O15438 1527 aa21.71■■□□□ 1.07
CHCHD2-201ENST00000395422 TSPY4P0CV99 314 aa21.69■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TSPY10P0CW01 314 aa21.69■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ERVK-7P63135 1459 aa21.69■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.69■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CHCHD2-201ENST00000395422 LTKP29376 864 aa21.64■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 SYNMO15061 1565 aa21.64■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.63■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.59■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.58■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.58■■□□□ 1.05
CHCHD2-201ENST00000395422 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.58■■□□□ 1.04
CHCHD2-201ENST00000395422 SLIT1O75093 1534 aa21.56■■□□□ 1.04
CHCHD2-201ENST00000395422 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CHCHD2-201ENST00000395422 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.55■■□□□ 1.04
CHCHD2-201ENST00000395422 CEP152O94986 1710 aa21.52■■□□□ 1.04
CHCHD2-201ENST00000395422 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.51■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.51■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 POTEAQ6S8J7 498 aa21.5■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.49■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM94Q12767 1356 aa21.48■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.48■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 EID1Q9Y6B2 187 aa21.48■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF15Q9NS87 1388 aa21.47■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.46■■□□□ 1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.45■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.44■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 PIK3C2BO00750 1634 aa21.44■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ERBINQ96RT1 1412 aa21.43■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 MAP3K1Q13233 1512 aa21.43■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCC5O15440 1437 aa21.42■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNA6P17658 529 aa21.42■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 IDI1Q13907 227 aa21.41■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.41■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.4■■□□□ 1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TET3O43151 1660 aa21.38■■□□□ 1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.38■■□□□ 1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.37■■□□□ 1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.34■■□□□ 1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 KANK1Q14678 1352 aa21.33■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 NOS1P29475 1434 aa21.32■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 DAPK1P53355 1430 aa21.32■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.32■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 NWD1Q149M9 1564 aa21.31■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.31■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 MSH6P52701 1360 aa21.29■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 SLAIN2Q9P270 581 aa21.29■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 ADGRB3O60242 1522 aa21.29■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.28■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.28■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 JCADQ9P266 1359 aa21.27■■□□□ 1
CHCHD2-201ENST00000395422 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms