RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394588.3

NMB-202, Transcript of neuromedin B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-202ENST00000394588 ERBINQ96RT1 1412 aa40.81■■■■■ 4.12
NMB-202ENST00000394588 C3P01024 1663 aa40.8■■■■■ 4.12
NMB-202ENST00000394588 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
NMB-202ENST00000394588 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.75■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.75■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.73■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 ITGAEP38570 1179 aa40.72■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 ROCK1Q13464 1354 aa40.72■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.71■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.7■■■■■ 4.11
NMB-202ENST00000394588 DEPDC5O75140 1603 aa40.69■■■■■ 4.1
NMB-202ENST00000394588 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
NMB-202ENST00000394588 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
NMB-202ENST00000394588 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
NMB-202ENST00000394588 ZMYM3Q14202 1370 aa40.62■■■■■ 4.09
NMB-202ENST00000394588 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.61■■■■■ 4.09
NMB-202ENST00000394588 CEP152O94986 1710 aa40.6■■■■■ 4.09
NMB-202ENST00000394588 ABCC3O15438 1527 aa40.6■■■■■ 4.09
NMB-202ENST00000394588 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.56■■■■■ 4.08
NMB-202ENST00000394588 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.56■■■■■ 4.08
NMB-202ENST00000394588 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.51■■■■■ 4.08
NMB-202ENST00000394588 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.51■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 NPATQ14207 1427 aa40.5■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.5■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.49■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 UNC13BO14795 1591 aa40.48■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 PZPP20742 1482 aa40.47■■■■■ 4.07
NMB-202ENST00000394588 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
NMB-202ENST00000394588 KANK1Q14678 1352 aa40.43■■■■■ 4.06
NMB-202ENST00000394588 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.41■■■■■ 4.06
NMB-202ENST00000394588 NAIPQ13075 1403 aa40.4■■■■■ 4.06
NMB-202ENST00000394588 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.38■■■■■ 4.05
NMB-202ENST00000394588 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.38■■■■■ 4.05
NMB-202ENST00000394588 HFM1A2PYH4 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
NMB-202ENST00000394588 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.33■■■■■ 4.05
NMB-202ENST00000394588 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.31■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.31■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.3■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 TET3O43151 1660 aa40.28■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 ERVK-7P63135 1459 aa40.27■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 TNRQ92752 1358 aa40.26■■■■■ 4.04
NMB-202ENST00000394588 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
NMB-202ENST00000394588 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
NMB-202ENST00000394588 HSPA2P54652 639 aa40.22■■■■■ 4.03
NMB-202ENST00000394588 NUP155O75694 1391 aa40.18■■■■■ 4.02
NMB-202ENST00000394588 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.15■■■■■ 4.02
NMB-202ENST00000394588 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
NMB-202ENST00000394588 NLRP1Q9C000 1473 aa40.13■■■■■ 4.02
NMB-202ENST00000394588 E9PCH4 1651 aa40.13■■■■■ 4.01
NMB-202ENST00000394588 SYNMO15061 1565 aa40.08■■■■■ 4.01
NMB-202ENST00000394588 NOS1P29475 1434 aa40.07■■■■■ 4
NMB-202ENST00000394588 STRCQ7RTU9 1775 aa40.05■■■■■ 4
NMB-202ENST00000394588 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.99■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.98■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 PLA2R1Q13018 1463 aa39.97■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 PIK3C2BO00750 1634 aa39.97■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 TRIM52Q96A61 297 aa39.95■■■■□ 3.99
NMB-202ENST00000394588 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.91■■■■□ 3.98
NMB-202ENST00000394588 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
NMB-202ENST00000394588 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.87■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 IDI1Q13907 227 aa39.84■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 ADGRB3O60242 1522 aa39.84■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.82■■■■□ 3.97
NMB-202ENST00000394588 PTPRTO14522 1441 aa39.81■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.78■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.77■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 PKD2Q13563 968 aa39.76■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.76■■■■□ 3.96
NMB-202ENST00000394588 TRPM2O94759 1503 aa39.75■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 SLIT1O75093 1534 aa39.75■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.75■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.74■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.74■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.71■■■■□ 3.95
NMB-202ENST00000394588 CLTCL1P53675 1640 aa39.69■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.69■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.67■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.65■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 MED14O60244 1454 aa39.64■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 HRCP23327 699 aa39.64■■■■□ 3.94
NMB-202ENST00000394588 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
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NMB-202ENST00000394588 FOXD1Q16676 465 aa39.59■■■■□ 3.93
NMB-202ENST00000394588 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
NMB-202ENST00000394588 KIF1BO60333 1816 aa39.57■■■■□ 3.93
NMB-202ENST00000394588 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 LTKP29376 864 aa39.55■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.54■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 ZFYVE9O95405 1425 aa39.54■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 EID1Q9Y6B2 187 aa39.52■■■■□ 3.92
NMB-202ENST00000394588 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.49■■■■□ 3.91
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