RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.97■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.97■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.96■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC5O15440 1437 aa41.95■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.94■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CERKQ8TCT0 537 aa41.92■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.92■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRTO14522 1441 aa41.92■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 PZPP20742 1482 aa41.89■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
GNPTAB-202ENST00000392919 DAPK1P53355 1430 aa41.87■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.87■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.85■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.85■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.84■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 TNRQ92752 1358 aa41.83■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF15Q9NS87 1388 aa41.82■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.82■■■■■ 4.29
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC3O15438 1527 aa41.81■■■■■ 4.28
GNPTAB-202ENST00000392919 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.81■■■■■ 4.28
GNPTAB-202ENST00000392919 PLA2R1Q13018 1463 aa41.78■■■■■ 4.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.75■■■■■ 4.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP152O94986 1710 aa41.72■■■■■ 4.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ERBINQ96RT1 1412 aa41.7■■■■■ 4.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PKD2Q13563 968 aa41.69■■■■■ 4.26
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
GNPTAB-202ENST00000392919 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.68■■■■■ 4.26
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.63■■■■■ 4.26
GNPTAB-202ENST00000392919 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.62■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP1Q9C000 1473 aa41.61■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVK-7P63135 1459 aa41.6■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 DEPDC5O75140 1603 aa41.58■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
GNPTAB-202ENST00000392919 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.55■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRL2O95490 1459 aa41.53■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.52■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.47■■■■■ 4.23
GNPTAB-202ENST00000392919 KANK1Q14678 1352 aa41.45■■■■■ 4.23
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.44■■■■■ 4.22
GNPTAB-202ENST00000392919 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.42■■■■■ 4.22
GNPTAB-202ENST00000392919 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.36■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.36■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGAEP38570 1179 aa41.33■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MED14O60244 1454 aa41.32■■■■■ 4.2
GNPTAB-202ENST00000392919 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.26■■■■■ 4.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PIK3C2BO00750 1634 aa41.25■■■■■ 4.19
GNPTAB-202ENST00000392919 IQGAP1P46940 1657 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTAB-202ENST00000392919 ROCK1Q13464 1354 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNMO15061 1565 aa41.21■■■■■ 4.19
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.19■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 LTKP29376 864 aa41.18■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 IDI1Q13907 227 aa41.18■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 NOS1P29475 1434 aa41.18■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SLIT1O75093 1534 aa41.17■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC13BO14795 1591 aa41.15■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 CPS1P31327 1500 aa41.14■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.14■■■■■ 4.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.13■■■■■ 4.17
GNPTAB-202ENST00000392919 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.11■■■■■ 4.17
GNPTAB-202ENST00000392919 TET3O43151 1660 aa41.1■■■■■ 4.17
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.08■■■■■ 4.17
GNPTAB-202ENST00000392919 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
GNPTAB-202ENST00000392919 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.07■■■■■ 4.16
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
GNPTAB-202ENST00000392919 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.04■■■■■ 4.16
GNPTAB-202ENST00000392919 EID1Q9Y6B2 187 aa41.03■■■■■ 4.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRB3O60242 1522 aa41■■■■■ 4.15
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41■■■■■ 4.15
GNPTAB-202ENST00000392919 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.98■■■■■ 4.15
GNPTAB-202ENST00000392919 E9PCH4 1651 aa40.98■■■■■ 4.15
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP155O75694 1391 aa40.94■■■■■ 4.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NAIPQ13075 1403 aa40.93■■■■■ 4.14
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.92■■■■■ 4.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.89■■■■■ 4.14
GNPTAB-202ENST00000392919 HFM1A2PYH4 1435 aa40.88■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 PIP4K2BP78356 416 aa40.86■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 TOM1O60784 492 aa40.85■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.84■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ALKQ9UM73 1620 aa40.84■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.82■■■■■ 4.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms