RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383490.2

TMEM200C-201, Transcript of transmembrane protein 200C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TMEM200C, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200C-201ENST00000383490 KIF3BO15066 747 aa36.71■■■■□ 3.47
TMEM200C-201ENST00000383490 NEUROD1Q13562 356 aa36.69■■■■□ 3.46
TMEM200C-201ENST00000383490 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
TMEM200C-201ENST00000383490 NUP155O75694 1391 aa36.68■■■■□ 3.46
TMEM200C-201ENST00000383490 ATP10AO60312 1499 aa36.68■■■■□ 3.46
TMEM200C-201ENST00000383490 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.65■■■■□ 3.46
TMEM200C-201ENST00000383490 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.63■■■■□ 3.45
TMEM200C-201ENST00000383490 PZPP20742 1482 aa36.61■■■■□ 3.45
TMEM200C-201ENST00000383490 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
TMEM200C-201ENST00000383490 UNC13BO14795 1591 aa36.6■■■■□ 3.45
TMEM200C-201ENST00000383490 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
TMEM200C-201ENST00000383490 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.55■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 TONSLQ96HA7 1378 aa36.55■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 GGT6Q6P531 493 aa36.55■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 FOXD1Q16676 465 aa36.53■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 DEPDC5O75140 1603 aa36.53■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 REREQ9P2R6 1566 aa36.52■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.52■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.51■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.51■■■■□ 3.44
TMEM200C-201ENST00000383490 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.48■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 PKD2Q13563 968 aa36.47■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.46■■■■□ 3.43
TMEM200C-201ENST00000383490 AGLP35573 1532 aa36.44■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 KANK1Q14678 1352 aa36.44■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.42■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 MLECQ14165 292 aa36.4■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.39■■■■□ 3.42
TMEM200C-201ENST00000383490 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.36■■■■□ 3.41
TMEM200C-201ENST00000383490 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
TMEM200C-201ENST00000383490 ABCC3O15438 1527 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM200C-201ENST00000383490 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.28■■■■□ 3.4
TMEM200C-201ENST00000383490 CEP152O94986 1710 aa36.28■■■■□ 3.4
TMEM200C-201ENST00000383490 TET3O43151 1660 aa36.25■■■■□ 3.39
TMEM200C-201ENST00000383490 E9PCH4 1651 aa36.22■■■■□ 3.39
TMEM200C-201ENST00000383490 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM200C-201ENST00000383490 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM200C-201ENST00000383490 PLA2R1Q13018 1463 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM200C-201ENST00000383490 NPATQ14207 1427 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM200C-201ENST00000383490 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
TMEM200C-201ENST00000383490 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.14■■■■□ 3.38
TMEM200C-201ENST00000383490 MIER1Q8N108 512 aa36.12■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.1■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 PTPRTO14522 1441 aa36.08■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.08■■■■□ 3.37
TMEM200C-201ENST00000383490 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.03■■■■□ 3.36
TMEM200C-201ENST00000383490 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TMEM200C-201ENST00000383490 ZMYM3Q14202 1370 aa36.01■■■■□ 3.36
TMEM200C-201ENST00000383490 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.01■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 TRPM2O94759 1503 aa36.01■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 NOS1P29475 1434 aa35.97■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.97■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.96■■■■□ 3.35
TMEM200C-201ENST00000383490 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 CLTCL1P53675 1640 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 ERVK-7P63135 1459 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 SYNMO15061 1565 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM200C-201ENST00000383490 MADDQ8WXG6 1647 aa35.87■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.86■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 RGL3Q3MIN7 710 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 MROH2AA6NES4 1674 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.83■■■■□ 3.33
TMEM200C-201ENST00000383490 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.82■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 IDI1Q13907 227 aa35.81■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.8■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.78■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 C3P01024 1663 aa35.77■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 PIK3C2BO00750 1634 aa35.76■■■■□ 3.32
TMEM200C-201ENST00000383490 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.76■■■■□ 3.31
TMEM200C-201ENST00000383490 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.73■■■■□ 3.31
TMEM200C-201ENST00000383490 TNRQ92752 1358 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM200C-201ENST00000383490 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
TMEM200C-201ENST00000383490 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.69■■■■□ 3.3
TMEM200C-201ENST00000383490 KIF1BO60333 1816 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM200C-201ENST00000383490 ADGRB3O60242 1522 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM200C-201ENST00000383490 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TMEM200C-201ENST00000383490 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM200C-201ENST00000383490 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.62■■■■□ 3.29
TMEM200C-201ENST00000383490 PTPRMP28827 1452 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM200C-201ENST00000383490 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.59■■■■□ 3.29
TMEM200C-201ENST00000383490 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.59■■■■□ 3.29
TMEM200C-201ENST00000383490 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM200C-201ENST00000383490 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.56■■■■□ 3.28
TMEM200C-201ENST00000383490 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms