RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 DEPDC5O75140 1603 aa41.17■■■■■ 4.18
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SLC22A23-201ENST00000380298 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.95■■■■■ 4.15
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SLC22A23-201ENST00000380298 C3P01024 1663 aa40.77■■■■■ 4.12
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SLC22A23-201ENST00000380298 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
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SLC22A23-201ENST00000380298 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.58■■■■■ 4.09
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SLC22A23-201ENST00000380298 SYNMO15061 1565 aa40.44■■■■■ 4.06
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SLC22A23-201ENST00000380298 TRPM2O94759 1503 aa40.41■■■■■ 4.06
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SLC22A23-201ENST00000380298 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.32■■■■■ 4.05
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC22A23-201ENST00000380298 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.29■■■■■ 4.04
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SLC22A23-201ENST00000380298 SLIT1O75093 1534 aa40.01■■■■■ 4
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40■■■■□ 3.99
SLC22A23-201ENST00000380298 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SLC22A23-201ENST00000380298 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.98■■■■□ 3.99
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SLC22A23-201ENST00000380298 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.95■■■■□ 3.99
SLC22A23-201ENST00000380298 NEUROD1Q13562 356 aa39.94■■■■□ 3.98
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