RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375599.7

RSG1-201, Transcript of REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSG1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1-201ENST00000375599 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.16■■■■■ 4.34
RSG1-201ENST00000375599 PTPRMP28827 1452 aa42.13■■■■■ 4.34
RSG1-201ENST00000375599 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.12■■■■■ 4.33
RSG1-201ENST00000375599 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
RSG1-201ENST00000375599 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.05■■■■■ 4.32
RSG1-201ENST00000375599 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.03■■■■■ 4.32
RSG1-201ENST00000375599 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.01■■■■■ 4.32
RSG1-201ENST00000375599 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
RSG1-201ENST00000375599 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 KDM5DQ9BY66 1539 aa42■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.98■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 NAIPQ13075 1403 aa41.98■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 KANK1Q14678 1352 aa41.97■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 DEPDC5O75140 1603 aa41.97■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 HFM1A2PYH4 1435 aa41.97■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 ZMYM3Q14202 1370 aa41.96■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 MROH2AA6NES4 1674 aa41.96■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
RSG1-201ENST00000375599 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.91■■■■■ 4.3
RSG1-201ENST00000375599 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
RSG1-201ENST00000375599 ABCC3O15438 1527 aa41.89■■■■■ 4.3
RSG1-201ENST00000375599 C3P01024 1663 aa41.89■■■■■ 4.3
RSG1-201ENST00000375599 UNC13BO14795 1591 aa41.83■■■■■ 4.29
RSG1-201ENST00000375599 CEP152O94986 1710 aa41.81■■■■■ 4.28
RSG1-201ENST00000375599 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.81■■■■■ 4.28
RSG1-201ENST00000375599 NUP155O75694 1391 aa41.76■■■■■ 4.28
RSG1-201ENST00000375599 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.75■■■■■ 4.27
RSG1-201ENST00000375599 PZPP20742 1482 aa41.75■■■■■ 4.27
RSG1-201ENST00000375599 NPATQ14207 1427 aa41.75■■■■■ 4.27
RSG1-201ENST00000375599 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.74■■■■■ 4.27
RSG1-201ENST00000375599 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.72■■■■■ 4.27
RSG1-201ENST00000375599 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.69■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 TRIM52Q96A61 297 aa41.67■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.66■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
RSG1-201ENST00000375599 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.63■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 TET3O43151 1660 aa41.61■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.59■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 TNRQ92752 1358 aa41.59■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.58■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.57■■■■■ 4.25
RSG1-201ENST00000375599 ERVK-7P63135 1459 aa41.56■■■■■ 4.24
RSG1-201ENST00000375599 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RSG1-201ENST00000375599 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.54■■■■■ 4.24
RSG1-201ENST00000375599 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.51■■■■■ 4.24
RSG1-201ENST00000375599 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
RSG1-201ENST00000375599 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
RSG1-201ENST00000375599 HRCP23327 699 aa41.46■■■■■ 4.23
RSG1-201ENST00000375599 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.46■■■■■ 4.23
RSG1-201ENST00000375599 E9PCH4 1651 aa41.44■■■■■ 4.22
RSG1-201ENST00000375599 NLRP1Q9C000 1473 aa41.43■■■■■ 4.22
RSG1-201ENST00000375599 NOS1P29475 1434 aa41.42■■■■■ 4.22
RSG1-201ENST00000375599 PKD2Q13563 968 aa41.38■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.37■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 HSPA2P54652 639 aa41.36■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.36■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.33■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 SYNMO15061 1565 aa41.32■■■■■ 4.21
RSG1-201ENST00000375599 IDI1Q13907 227 aa41.28■■■■■ 4.2
RSG1-201ENST00000375599 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.26■■■■■ 4.2
RSG1-201ENST00000375599 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
RSG1-201ENST00000375599 PTPRTO14522 1441 aa41.24■■■■■ 4.19
RSG1-201ENST00000375599 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.23■■■■■ 4.19
RSG1-201ENST00000375599 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.22■■■■■ 4.19
RSG1-201ENST00000375599 FOXD1Q16676 465 aa41.18■■■■■ 4.18
RSG1-201ENST00000375599 PIK3C2BO00750 1634 aa41.18■■■■■ 4.18
RSG1-201ENST00000375599 TRPM2O94759 1503 aa41.14■■■■■ 4.18
RSG1-201ENST00000375599 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.13■■■■■ 4.18
RSG1-201ENST00000375599 PLA2R1Q13018 1463 aa41.12■■■■■ 4.17
RSG1-201ENST00000375599 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
RSG1-201ENST00000375599 ADGRB3O60242 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
RSG1-201ENST00000375599 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
RSG1-201ENST00000375599 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.08■■■■■ 4.17
RSG1-201ENST00000375599 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.03■■■■■ 4.16
RSG1-201ENST00000375599 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.01■■■■■ 4.16
RSG1-201ENST00000375599 CLTCL1P53675 1640 aa41.01■■■■■ 4.16
RSG1-201ENST00000375599 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.01■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 STRCQ7RTU9 1775 aa41■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.99■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.99■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.99■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 SLIT1O75093 1534 aa40.98■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 EID1Q9Y6B2 187 aa40.97■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.96■■■■■ 4.15
RSG1-201ENST00000375599 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.93■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.9■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.9■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 KIF1BO60333 1816 aa40.89■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
RSG1-201ENST00000375599 LTKP29376 864 aa40.88■■■■■ 4.13
RSG1-201ENST00000375599 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms