RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371421.8

ARRDC1-201, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-201ENST00000371421 GGT6Q6P531 493 aa42.65■■■■■ 4.42
ARRDC1-201ENST00000371421 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.419e-8■■■■□ 24.5
ARRDC1-201ENST00000371421 TRIM52Q96A61 297 aa42.59■■■■■ 4.41
ARRDC1-201ENST00000371421 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
ARRDC1-201ENST00000371421 MLECQ14165 292 aa42.58■■■■■ 4.41
ARRDC1-201ENST00000371421 DEPDC5O75140 1603 aa42.56■■■■■ 4.4
ARRDC1-201ENST00000371421 UNC13BO14795 1591 aa42.54■■■■■ 4.4
ARRDC1-201ENST00000371421 NUP155O75694 1391 aa42.54■■■■■ 4.4
ARRDC1-201ENST00000371421 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.53■■■■■ 4.4
ARRDC1-201ENST00000371421 KANK1Q14678 1352 aa42.52■■■■■ 4.4
ARRDC1-201ENST00000371421 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.51■■■■■ 4.39
ARRDC1-201ENST00000371421 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
ARRDC1-201ENST00000371421 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.45■■■■■ 4.39
ARRDC1-201ENST00000371421 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.42■■■■■ 4.38
ARRDC1-201ENST00000371421 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.41■■■■■ 4.38
ARRDC1-201ENST00000371421 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
ARRDC1-201ENST00000371421 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.38■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.37■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 PZPP20742 1482 aa42.34■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.34■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCC3O15438 1527 aa42.33■■■■■ 4.37
ARRDC1-201ENST00000371421 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
ARRDC1-201ENST00000371421 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.31■■■■■ 4.36
ARRDC1-201ENST00000371421 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.29■■■■■ 4.36
ARRDC1-201ENST00000371421 CEP152O94986 1710 aa42.28■■■■■ 4.36
ARRDC1-201ENST00000371421 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.26■■■■■ 4.36
ARRDC1-201ENST00000371421 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
ARRDC1-201ENST00000371421 TET3O43151 1660 aa42.23■■■■■ 4.35
ARRDC1-201ENST00000371421 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.23■■■■■ 4.35
ARRDC1-201ENST00000371421 PKD2Q13563 968 aa42.22■■■■■ 4.35
ARRDC1-201ENST00000371421 MADDQ8WXG6 1647 aa42.2■■■■■ 4.35
ARRDC1-201ENST00000371421 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.19■■■■■ 4.34
ARRDC1-201ENST00000371421 ZMYM3Q14202 1370 aa42.19■■■■■ 4.34
ARRDC1-201ENST00000371421 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
ARRDC1-201ENST00000371421 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.17■■■■■ 4.34
ARRDC1-201ENST00000371421 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.16■■■■■ 4.34
ARRDC1-201ENST00000371421 MROH2AA6NES4 1674 aa42.13■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 NPATQ14207 1427 aa42.13■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 FOXD1Q16676 465 aa42.1■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 E9PCH4 1651 aa42.1■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.07■■■■■ 4.33
ARRDC1-201ENST00000371421 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
ARRDC1-201ENST00000371421 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
ARRDC1-201ENST00000371421 C3P01024 1663 aa41.99■■■■■ 4.31
ARRDC1-201ENST00000371421 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
ARRDC1-201ENST00000371421 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.97■■■■■ 4.31
ARRDC1-201ENST00000371421 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
ARRDC1-201ENST00000371421 PTPRMP28827 1452 aa41.97■■■■■ 4.31
ARRDC1-201ENST00000371421 PTPRTO14522 1441 aa41.94■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.93■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 NOS1P29475 1434 aa41.93■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 ERVK-7P63135 1459 aa41.93■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.91■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 PLA2R1Q13018 1463 aa41.89■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.89■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.88■■■■■ 4.3
ARRDC1-201ENST00000371421 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.84■■■■■ 4.29
ARRDC1-201ENST00000371421 TRPM2O94759 1503 aa41.83■■■■■ 4.29
ARRDC1-201ENST00000371421 TNRQ92752 1358 aa41.83■■■■■ 4.29
ARRDC1-201ENST00000371421 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.81■■■■■ 4.28
ARRDC1-201ENST00000371421 SYNMO15061 1565 aa41.8■■■■■ 4.28
ARRDC1-201ENST00000371421 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.79■■■■■ 4.28
ARRDC1-201ENST00000371421 IDI1Q13907 227 aa41.74■■■■■ 4.27
ARRDC1-201ENST00000371421 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.72■■■■■ 4.27
ARRDC1-201ENST00000371421 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.71■■■■■ 4.27
ARRDC1-201ENST00000371421 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
ARRDC1-201ENST00000371421 PIK3C2BO00750 1634 aa41.69■■■■■ 4.26
ARRDC1-201ENST00000371421 CLTCL1P53675 1640 aa41.69■■■■■ 4.26
ARRDC1-201ENST00000371421 NLRP1Q9C000 1473 aa41.67■■■■■ 4.26
ARRDC1-201ENST00000371421 NEUROD1Q13562 356 aa41.65■■■■■ 4.26
ARRDC1-201ENST00000371421 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
ARRDC1-201ENST00000371421 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.59■■■■■ 4.25
ARRDC1-201ENST00000371421 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.58■■■■■ 4.25
ARRDC1-201ENST00000371421 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.55■■■■■ 4.24
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF1BO60333 1816 aa41.55■■■■■ 4.24
ARRDC1-201ENST00000371421 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.53■■■■■ 4.24
ARRDC1-201ENST00000371421 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.5■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 RGL3Q3MIN7 710 aa41.5■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 ADGRB3O60242 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.48■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.47■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
ARRDC1-201ENST00000371421 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
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ARRDC1-201ENST00000371421 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
ARRDC1-201ENST00000371421 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.44■■■■■ 4.22
ARRDC1-201ENST00000371421 TONSLQ96HA7 1378 aa41.41■■■■■ 4.22
ARRDC1-201ENST00000371421 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.38■■■■■ 4.22
ARRDC1-201ENST00000371421 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.38■■■■■ 4.22
ARRDC1-201ENST00000371421 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.37■■■■■ 4.21
ARRDC1-201ENST00000371421 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.36■■■■■ 4.21
ARRDC1-201ENST00000371421 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.32■■■■■ 4.2
ARRDC1-201ENST00000371421 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.31■■■■■ 4.2
ARRDC1-201ENST00000371421 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
ARRDC1-201ENST00000371421 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.29■■■■■ 4.2
ARRDC1-201ENST00000371421 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.26■■■■■ 4.2
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