RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GGT6Q6P531 493 aa44.06■■■■■ 4.64
ECHS1-201ENST00000368547 UNC13BO14795 1591 aa44.06■■■■■ 4.64
ECHS1-201ENST00000368547 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.05■■■■■ 4.64
ECHS1-201ENST00000368547 MLECQ14165 292 aa44.04■■■■■ 4.64
ECHS1-201ENST00000368547 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.01■■■■■ 4.642e-8■■■■□ 23
ECHS1-201ENST00000368547 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
ECHS1-201ENST00000368547 HRCP23327 699 aa43.96■■■■■ 4.63
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM52Q96A61 297 aa43.95■■■■■ 4.63
ECHS1-201ENST00000368547 NUP155O75694 1391 aa43.92■■■■■ 4.62
ECHS1-201ENST00000368547 KANK1Q14678 1352 aa43.9■■■■■ 4.62
ECHS1-201ENST00000368547 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.89■■■■■ 4.62
ECHS1-201ENST00000368547 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
ECHS1-201ENST00000368547 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.88■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 CEP152O94986 1710 aa43.87■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.87■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.85■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.84■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.83■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.82■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.82■■■■■ 4.61
ECHS1-201ENST00000368547 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC3O15438 1527 aa43.81■■■■■ 4.6
ECHS1-201ENST00000368547 PZPP20742 1482 aa43.78■■■■■ 4.6
ECHS1-201ENST00000368547 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
ECHS1-201ENST00000368547 MADDQ8WXG6 1647 aa43.77■■■■■ 4.6
ECHS1-201ENST00000368547 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.75■■■■■ 4.59
ECHS1-201ENST00000368547 TET3O43151 1660 aa43.72■■■■■ 4.59
ECHS1-201ENST00000368547 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.72■■■■■ 4.59
ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ECHS1-201ENST00000368547 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.69■■■■■ 4.59
ECHS1-201ENST00000368547 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.69■■■■■ 4.58
ECHS1-201ENST00000368547 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
ECHS1-201ENST00000368547 MROH2AA6NES4 1674 aa43.67■■■■■ 4.58
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.66■■■■■ 4.58
ECHS1-201ENST00000368547 E9PCH4 1651 aa43.62■■■■■ 4.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZMYM3Q14202 1370 aa43.59■■■■■ 4.57
ECHS1-201ENST00000368547 PKD2Q13563 968 aa43.59■■■■■ 4.57
ECHS1-201ENST00000368547 NPATQ14207 1427 aa43.56■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.56■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 C3P01024 1663 aa43.56■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.55■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 FOXD1Q16676 465 aa43.51■■■■■ 4.56
ECHS1-201ENST00000368547 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRMP28827 1452 aa43.46■■■■■ 4.55
ECHS1-201ENST00000368547 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.44■■■■■ 4.55
ECHS1-201ENST00000368547 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.44■■■■■ 4.55
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
ECHS1-201ENST00000368547 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.4■■■■■ 4.54
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-7P63135 1459 aa43.39■■■■■ 4.54
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.36■■■■■ 4.53
ECHS1-201ENST00000368547 NOS1P29475 1434 aa43.34■■■■■ 4.53
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRTO14522 1441 aa43.33■■■■■ 4.53
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2R1Q13018 1463 aa43.31■■■■■ 4.52
ECHS1-201ENST00000368547 SYNMO15061 1565 aa43.31■■■■■ 4.52
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM2O94759 1503 aa43.28■■■■■ 4.52
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.28■■■■■ 4.52
ECHS1-201ENST00000368547 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
ECHS1-201ENST00000368547 TNRQ92752 1358 aa43.24■■■■■ 4.51
ECHS1-201ENST00000368547 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.22■■■■■ 4.51
ECHS1-201ENST00000368547 CLTCL1P53675 1640 aa43.18■■■■■ 4.5
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3C2BO00750 1634 aa43.17■■■■■ 4.5
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.15■■■■■ 4.5
ECHS1-201ENST00000368547 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
ECHS1-201ENST00000368547 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
ECHS1-201ENST00000368547 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.13■■■■■ 4.49
ECHS1-201ENST00000368547 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.12■■■■■ 4.49
ECHS1-201ENST00000368547 IDI1Q13907 227 aa43.11■■■■■ 4.49
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP1Q9C000 1473 aa43.08■■■■■ 4.49
ECHS1-201ENST00000368547 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.07■■■■■ 4.49
ECHS1-201ENST00000368547 SIN3AQ96ST3 1273 aa43.06■■■■■ 4.48
ECHS1-201ENST00000368547 KIF1BO60333 1816 aa43.05■■■■■ 4.48
ECHS1-201ENST00000368547 NEUROD1Q13562 356 aa42.98■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.97■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.97■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 CHGAP10645 457 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.96■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 MYO5BQ9ULV0 1848 aa42.96■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRB3O60242 1522 aa42.95■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.95■■■■■ 4.47
ECHS1-201ENST00000368547 STAG3Q9UJ98 1225 aa42.93■■■■■ 4.46
ECHS1-201ENST00000368547 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.89■■■■■ 4.46
ECHS1-201ENST00000368547 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
ECHS1-201ENST00000368547 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.85■■■■■ 4.45
ECHS1-201ENST00000368547 RGL3Q3MIN7 710 aa42.84■■■■■ 4.45
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
ECHS1-201ENST00000368547 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.78■■■■■ 4.44
ECHS1-201ENST00000368547 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
ECHS1-201ENST00000368547 TONSLQ96HA7 1378 aa42.72■■■■■ 4.43
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.7■■■■■ 4.43
ECHS1-201ENST00000368547 IFT172Q9UG01 1749 aa42.69■■■■■ 4.43
ECHS1-201ENST00000368547 PPLO60437 1756 aa42.69■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.69■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 SLIT1O75093 1534 aa42.68■■■■■ 4.42
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