RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 GLI2P10070 1586 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.49■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.48■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 ZMYND15Q9H091 742 aa20.47■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 PLCH2O75038 1416 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC13-201ENST00000366661 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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TTC13-201ENST00000366661 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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TTC13-201ENST00000366661 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TTC13-201ENST00000366661 PKD2Q13563 968 aa20.44■□□□□ 0.86
TTC13-201ENST00000366661 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC13-201ENST00000366661 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC13-201ENST00000366661 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.42■□□□□ 0.86
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TTC13-201ENST00000366661 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC13-201ENST00000366661 CD109Q6YHK3 1445 aa20.37■□□□□ 0.85
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TTC13-201ENST00000366661 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.36■□□□□ 0.85
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TTC13-201ENST00000366661 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.36■□□□□ 0.85
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TTC13-201ENST00000366661 USP35Q9P2H5 1018 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC13-201ENST00000366661 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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TTC13-201ENST00000366661 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.32■□□□□ 0.84
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TTC13-201ENST00000366661 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.28■□□□□ 0.84
TTC13-201ENST00000366661 MBD5Q9P267 1494 aa20.28■□□□□ 0.84
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TTC13-201ENST00000366661 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC13-201ENST00000366661 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC13-201ENST00000366661 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.25■□□□□ 0.83
TTC13-201ENST00000366661 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.24■□□□□ 0.83
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TTC13-201ENST00000366661 ADGRL1O94910 1474 aa20.23■□□□□ 0.83
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TTC13-201ENST00000366661 ADGRL2O95490 1459 aa20.22■□□□□ 0.83
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TTC13-201ENST00000366661 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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TTC13-201ENST00000366661 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.16■□□□□ 0.82
TTC13-201ENST00000366661 PLXNC1O60486 1568 aa20.15■□□□□ 0.82
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TTC13-201ENST00000366661 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.15■□□□□ 0.82
TTC13-201ENST00000366661 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TTC13-201ENST00000366661 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.14■□□□□ 0.82
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TTC13-201ENST00000366661 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TTC13-201ENST00000366661 RICTORQ6R327 1708 aa20.13■□□□□ 0.81
TTC13-201ENST00000366661 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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