RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362091.8

FBXO18-201, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO18, Length 3,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-201ENST00000362091 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
FBXO18-201ENST00000362091 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FBXO18-201ENST00000362091 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.3■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.3■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.29■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.29■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 PBRM1Q86U86 1689 aa22.29■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 E9PCH4 1651 aa22.28■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.28■■□□□ 1.16
FBXO18-201ENST00000362091 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 ADAMTS12P58397 1594 aa22.24■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 ADGRL2O95490 1459 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 DISP1Q96F81 1524 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 RGL3Q3MIN7 710 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 KIAA0556O60303 1618 aa22.21■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 RGS3P49796 1198 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXO18-201ENST00000362091 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 C8orf34Q49A92 452 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 FAM161AQ3B820 660 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 PANK3Q9H999 370 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXO18-201ENST00000362091 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.13■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.13■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 CEP170Q5SW79 1584 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 TSPY4P0CV99 314 aa22.11■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 TSPY10P0CW01 314 aa22.11■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.09■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.09■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.09■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.08■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 22.7
FBXO18-201ENST00000362091 TESK2Q96S53 571 aa22.08■■□□□ 1.13
FBXO18-201ENST00000362091 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.06■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.05■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.03■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.03■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 GOLGA2Q08379 1002 aa22.03■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 ERBINQ96RT1 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
FBXO18-201ENST00000362091 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.116e-7■■■■□ 23.9
FBXO18-201ENST00000362091 INSRP06213 1382 aa22.02■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 TMF1P82094 1093 aa22.01■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.01■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC146Q8IYE0 955 aa22■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 POGKQ9P215 609 aa21.99■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 PTPRGP23470 1445 aa21.99■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.99■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 PPP2R1AP30153 589 aa21.99■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 BCAR3O75815 825 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 A2MP01023 1474 aa21.96■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.96■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.96■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.96■■□□□ 1.11
FBXO18-201ENST00000362091 ZNF521Q96K83 1311 aa21.95■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 SEC24BO95487 1268 aa21.95■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 IGHDP01880 384 aa21.94■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 SLFN5Q08AF3 891 aa21.94■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 GRIN2AQ12879 1464 aa21.93■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 USP19O94966 1318 aa21.93■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 FBLN2P98095 1184 aa21.93■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 ARXQ96QS3 562 aa21.92■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.91■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 PLA2R1Q13018 1463 aa21.9■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.9■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.9■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 APAF1O14727 1248 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO18-201ENST00000362091 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms