RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.5■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 ATP7AQ04656 1500 aa16.5■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 CLIP1P30622 1438 aa16.49■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.48■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 PZPP20742 1482 aa16.47■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.47■□□□□ 0.23
CSAG4-201ENST00000361201 FMN1Q68DA7 1419 aa16.45■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 MIA2Q96PC5 1412 aa16.45■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 NLRP1Q9C000 1473 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 TRIM52Q96A61 297 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.41■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.41■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 LRP6O75581 1613 aa16.4■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.4■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CSAG4-201ENST00000361201 JCADQ9P266 1359 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 LTKP29376 864 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 MAP3K1Q13233 1512 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 TMEM94Q12767 1356 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 PHLPP1O60346 1717 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 NCOA2Q15596 1464 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 KIF3BO15066 747 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 RXRBP28702 533 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 MBD5Q9P267 1494 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.28■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CSAG4-201ENST00000361201 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 SLIT1O75093 1534 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 EEA1Q15075 1411 aa16.26■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 SLAIN2Q9P270 581 aa16.24■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 RGS12O14924 1447 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 KCNA6P17658 529 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 ERVK-7P63135 1459 aa16.22■□□□□ 0.19
CSAG4-201ENST00000361201 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 TET3O43151 1660 aa16.18■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 SHPRHQ149N8 1683 aa16.18■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 TIAM1Q13009 1591 aa16.18■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 ABCC3O15438 1527 aa16.18■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.16■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 EP400Q96L91 3159 aa16.16■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 AFF2P51816 1311 aa16.15■□□□□ 0.18
CSAG4-201ENST00000361201 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 DIP2AQ14689 1571 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NWD1Q149M9 1564 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 MSH6P52701 1360 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 EID1Q9Y6B2 187 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CSAG4-201ENST00000361201 PIK3C2BO00750 1634 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 CEP152O94986 1710 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG4-201ENST00000361201 LRP5O75197 1615 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms