RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360059.5

GTPBP4-201, Transcript of GTP binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP4, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4-201ENST00000360059 NPATQ14207 1427 aa29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.48■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.48■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GTPBP4-201ENST00000360059 PTPRKQ15262 1439 aa29.45■■■□□ 2.3
GTPBP4-201ENST00000360059 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.45■■■□□ 2.3
GTPBP4-201ENST00000360059 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4-201ENST00000360059 ERBINQ96RT1 1412 aa29.41■■■□□ 2.3
GTPBP4-201ENST00000360059 NCOA1Q15788 1441 aa29.39■■■□□ 2.3
GTPBP4-201ENST00000360059 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.38■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 ADGRL2O95490 1459 aa29.37■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 PZPP20742 1482 aa29.36■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 ABCC3O15438 1527 aa29.35■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.33■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
GTPBP4-201ENST00000360059 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 TNRQ92752 1358 aa29.28■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.284e-11■□□□□ 9.8
GTPBP4-201ENST00000360059 CEP152O94986 1710 aa29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 DEPDC5O75140 1603 aa29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 STRCQ7RTU9 1775 aa29.26■■■□□ 2.28
GTPBP4-201ENST00000360059 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.23■■■□□ 2.27
GTPBP4-201ENST00000360059 ITGAEP38570 1179 aa29.23■■■□□ 2.27
GTPBP4-201ENST00000360059 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4-201ENST00000360059 KANK1Q14678 1352 aa29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4-201ENST00000360059 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4-201ENST00000360059 ROCK1Q13464 1354 aa29.2■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.19■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.18■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 ERVK-7P63135 1459 aa29.17■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.16■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 NLRP1Q9C000 1473 aa29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 PLA2R1Q13018 1463 aa29.14■■■□□ 2.26
GTPBP4-201ENST00000360059 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.13■■■□□ 2.25
GTPBP4-201ENST00000360059 PTPRTO14522 1441 aa29.12■■■□□ 2.25
GTPBP4-201ENST00000360059 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.12■■■□□ 2.25
GTPBP4-201ENST00000360059 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4-201ENST00000360059 PKD2Q13563 968 aa29.07■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.06■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 UNC13BO14795 1591 aa29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
GTPBP4-201ENST00000360059 TET3O43151 1660 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP4-201ENST00000360059 NOS1P29475 1434 aa28.95■■■□□ 2.23
GTPBP4-201ENST00000360059 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 CERKQ8TCT0 537 aa28.95■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.94■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 SYNMO15061 1565 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 NUP155O75694 1391 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 NAIPQ13075 1403 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 PIK3C2BO00750 1634 aa28.91■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 FBXO41Q8TF61 875 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 IDI1Q13907 227 aa28.89■■■□□ 2.22
GTPBP4-201ENST00000360059 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.86■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 MED14O60244 1454 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 E9PCH4 1651 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 HFM1A2PYH4 1435 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.84■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.84■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 SLIT1O75093 1534 aa28.83■■■□□ 2.21
GTPBP4-201ENST00000360059 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 ADGRB3O60242 1522 aa28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 LTKP29376 864 aa28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 IQGAP1P46940 1657 aa28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4-201ENST00000360059 EID1Q9Y6B2 187 aa28.76■■■□□ 2.19
GTPBP4-201ENST00000360059 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
GTPBP4-201ENST00000360059 TRIM52Q96A61 297 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP4-201ENST00000360059 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.68■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.65■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 CPS1P31327 1500 aa28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4-201ENST00000360059 ZFYVE9O95405 1425 aa28.62■■■□□ 2.17
GTPBP4-201ENST00000360059 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.61■■■□□ 2.17
GTPBP4-201ENST00000360059 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
GTPBP4-201ENST00000360059 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.56■■■□□ 2.16
GTPBP4-201ENST00000360059 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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