RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357658.4

SZT2-201, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SZT2, Length 1,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-201ENST00000357658 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 GGT6Q6P531 493 aa28.68■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 DEPDC5O75140 1603 aa28.68■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 C3P01024 1663 aa28.66■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.65■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.65■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.64■■■□□ 2.18
SZT2-201ENST00000357658 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.63■■■□□ 2.17
SZT2-201ENST00000357658 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SZT2-201ENST00000357658 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.61■■■□□ 2.17
SZT2-201ENST00000357658 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SZT2-201ENST00000357658 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.58■■■□□ 2.17
SZT2-201ENST00000357658 CEP152O94986 1710 aa28.57■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 ABCC3O15438 1527 aa28.56■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.55■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 ZMYM3Q14202 1370 aa28.54■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 NAIPQ13075 1403 aa28.54■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 UNC13BO14795 1591 aa28.53■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
SZT2-201ENST00000357658 HFM1A2PYH4 1435 aa28.51■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.51■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.49■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.47■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.46■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 PZPP20742 1482 aa28.45■■■□□ 2.15
SZT2-201ENST00000357658 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.43■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 NPATQ14207 1427 aa28.43■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 KANK1Q14678 1352 aa28.41■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.4■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.39■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.39■■■□□ 2.14
SZT2-201ENST00000357658 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.37■■■□□ 2.13
SZT2-201ENST00000357658 TET3O43151 1660 aa28.37■■■□□ 2.13
SZT2-201ENST00000357658 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.35■■■□□ 2.13
SZT2-201ENST00000357658 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SZT2-201ENST00000357658 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.34■■■□□ 2.13
SZT2-201ENST00000357658 ERVK-7P63135 1459 aa28.32■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 NUP155O75694 1391 aa28.31■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.29■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 E9PCH4 1651 aa28.29■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 TNRQ92752 1358 aa28.27■■■□□ 2.12
SZT2-201ENST00000357658 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SZT2-201ENST00000357658 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.26■■■□□ 2.11
SZT2-201ENST00000357658 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SZT2-201ENST00000357658 NOS1P29475 1434 aa28.22■■■□□ 2.11
SZT2-201ENST00000357658 SYNMO15061 1565 aa28.21■■■□□ 2.11
SZT2-201ENST00000357658 NLRP1Q9C000 1473 aa28.19■■■□□ 2.1
SZT2-201ENST00000357658 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.19■■■□□ 2.1
SZT2-201ENST00000357658 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.19■■■□□ 2.1
SZT2-201ENST00000357658 HSPA2P54652 639 aa28.17■■■□□ 2.1
SZT2-201ENST00000357658 TRIM52Q96A61 297 aa28.13■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.13■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 STRCQ7RTU9 1775 aa28.12■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 PIK3C2BO00750 1634 aa28.12■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.12■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.1■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SZT2-201ENST00000357658 PTPRTO14522 1441 aa28.07■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 HRCP23327 699 aa28.06■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 PLA2R1Q13018 1463 aa28.05■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 IDI1Q13907 227 aa28.04■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 PKD2Q13563 968 aa28.03■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.03■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.02■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.02■■■□□ 2.08
SZT2-201ENST00000357658 TRPM2O94759 1503 aa28.01■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 ADGRB3O60242 1522 aa28■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.99■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 CLTCL1P53675 1640 aa27.97■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 SLIT1O75093 1534 aa27.95■■■□□ 2.07
SZT2-201ENST00000357658 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.95■■■□□ 2.06
SZT2-201ENST00000357658 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.93■■■□□ 2.06
SZT2-201ENST00000357658 FOXD1Q16676 465 aa27.93■■■□□ 2.06
SZT2-201ENST00000357658 KIF1BO60333 1816 aa27.89■■■□□ 2.06
SZT2-201ENST00000357658 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.89■■■□□ 2.06
SZT2-201ENST00000357658 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.88■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 MED14O60244 1454 aa27.85■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.85■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 ZFYVE9O95405 1425 aa27.84■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.83■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SZT2-201ENST00000357658 LTKP29376 864 aa27.82■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 IQGAP1P46940 1657 aa27.81■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.81■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.78■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.78■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SZT2-201ENST00000357658 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.1 ms